琴叶南芥（学名：南芥属 lyrata var. kamchatica）是十字花科南芥属下的一个变种。

琴叶南芥为多年生草本，高10-30厘米。主根圆锥状，具须根。茎自基部分枝或不分枝，直立。基生叶卵形或倒披针形，基部两侧具小裂片2-4对，顶端裂片最大，长5-15毫米，宽6-12毫米，边缘全缘或有不规则的羽状分裂，两面与叶柄均被长单毛，2叉毛较少。茎生叶长圆形或披针形，长约2厘米，宽约7毫米，顶端急尖，边缘全缘或具钝齿蟳，表面近光滑，背面沿叶脉被单毛。总状花序顶生或腋生；萼片长椭圆形，长2-3.5毫米，背面近无毛；花瓣白色，倒卵形，长达6毫米，下部呈短爪；花柱短，柱头头状。长角果线形，长2-3.7厘米，宽约1.5毫米；果梗稍弯曲，斜伸展。种子每室1行，种子长圆形，无翅。

琴叶南芥产于吉林省（安图县、长白山）等地。此外，朝鲜、日本、苏联的俄罗斯远东地区及北美洲北部均有分布。模式标本采自苏联远东。

生长于海拔1700米的高山干燥砂砾质山坡。