秦佐八郎（1873年3月23日-1938年11月22日），日本岛根县出身的细菌学者，医学博士。他与德国学者保罗·埃尔利希共同发明了治疗梅毒的特效药洒尔佛散（又称凡纳明）。秦佐八郎曾三度被提名诺贝尔奖，但均未获奖。

秦佐八郎1891年毕业于私立冈山药学校，后于1895年毕业于第三高等中学校医学部。1898年，他进入国立传染病研究所工作，并在所长北里柴三郎的指导下研究鼠疫。

1907年，秦佐八郎赴德国罗伯·柯霍细菌研究所从事免疫研究，并在保罗·埃尔利希的指导下研究砒素药剂的效力。1909年，他与埃尔利希共同发现606号砒素剂对梅毒、疟疾都有特效，被认为是共同研制606剂成功的人。1910年，秦佐八郎回国任职于传染病研究所，1914年任北里研究所研究部长。

秦佐八郎曾三度被提名诺贝尔奖，分别是1911年的化学奖，1912年和1913年的生理学或医学奖。

秦佐八郎的养子秦藤树是北里大学校长，该校是为纪念日本首位诺贝尔奖候选人北里柴三郎而创。大村智（2015年诺贝尔生理学或医学奖得主）曾受到秦藤树的指导。