球孢虫属（学名：Sphaerospora）是球孢虫科的一个属。球孢虫属组织寄生或腔寄生。本属在我国淡水鱼类寄生的种类已知的有16种，它们寄生于鲤、草鱼、青鱼、、泥鳅、鮠、鮍、、鳜、斑鳜的鳃丝、膀胱及输尿管。常见种类有黑龙江球孢虫（S. amurensis Achmerov）、鳃丝球孢虫（S. branchialis Lee \u0026 Nie）、湖北球孢虫（S. hupehensis Lee \u0026 Nie）等。

孢子常为球形，缝线较平直。具极囊两个。壳上有条纹或在壳片的后端具膜状突。不具嗜碘泡。

分布于湖北、东北、四川省及浙江省和武陵山区。

本属包括以下物种：