100部队（日语：100部队，100ぶたい），又称关东军军马防疫给水部，是驻扎在吉林省长春市市郊孟家屯的一支军事单位，主要从事研究、制造和施行针对动物、植物和人畜的细菌武器。100部队确定了鼻疽菌（用于攻击马匹）、炭热菌（用于攻击牲畜）、牛瘟菌（用于攻击牛）和斑驳病（用于攻击谷物）为主要的进攻武器。此外，该部队还研究并生产其他细菌，如破坏蔬菜和稻米的细菌，以及用于直接攻击人类的细菌。 作为日本关东军仅有的三支生化战部队之一，100部队的主要业务是对驻满部队所拥有的军马进行防疫工作方面的协助。此外，该部队还研究并生产消灭牛、羊、马匹等牲畜的细菌，以及破坏小麦、裸麦、燕麦等植物的细菌。与负责情报工作的关东军司令部第二部谍报课密切配合，100部队还常在生产细菌的实验中与731部队交换信息。 2018年5月7日，来自俄罗斯国立录音档案馆的长春伪满皇宫博物院收藏的伯力审判录音档案正式被收录。这份录音档案长达22个小时，通过战犯的供述揭示了侵华日军第731部队、100部队的细菌战罪行。2022年8月，日本学者小河孝揭露了731部队的“恶魔兄弟”——侵华日军第100部队的细菌战罪行。同年9月，侵华日军第100部队细菌战的最新罪证在长春公布。

1931年11月，100部队的前身关东军临时病马收容所在沈阳市成立。

1933年2月，临时病马收容所改编为关东军临时病马厂，并迁至长春。

1936年8月1日，关东军在长春市郊区十公里外的孟家屯正式建立了“第100部队”，对外称“关东军军马防疫给水部”；驻地占地东西零点五公里，南北一公里，原址被用来兴建今天的中国一汽的散热器厂。

1937年，一份名为“关参一发第一八七七号”的命令文件正式下发，关东军司令官植田谦吉向日本陆军大臣杉山元命令提请“军用细菌研究从业者命令件”报告，任命高岛一雄等人从事军用细菌研究。第100部队从此前宣称的防疫研究，正式走向了有组织的国家军用细菌研究。

1940年底，根据关东军命令，部队采用秘密番号，称满洲第100部队。

日本战败前夕，100部队接到关东军司令山田乙三的命令，将大部分建筑物炸毁，还烧毁和撤走了几乎所有文字图片资料。

1949年12月，苏联主持进行细菌战审判，第100部队战犯高桥隆笃、平樱全作、三友一男等人受审。

100部队与731部队是孪生的一对恶魔。它们名义上都隶属于关东军司令部，实际上直接由日本大本营日军参谋本部指挥。100部队由关东军司令部的兽医部指导，负责人是中将兽医部长高桥隆笃。伪满大陆科学院的兽医处（对外称马疫研究所）处长安达诚太郎、中将北野政次对其也负有指导责任。其前身是驻屯在长春市宽城子的号称高桥部队的“关东军马匹防疫场”。1938年迁至长春以南10公里的孟家屯。经过扩建后，改用了“满洲第100部队”的秘密番号。

100部队位于日军营群中央的一块截然孤立的地方，营区面积东西宽1华里，南北长2华里。它的规模小于731部队，拥有日籍研究和工作人员800人，中国劳工大约300人。本部下设总务部和4个细菌生产研究部门，1940年以后，在大连市、海拉尔（后迁至克山）、佳木斯市、拉古（位于牡丹江市附近）等地建立了所属的支队。苏德战争爆发后不久，它除在四平市设立支队外，在关东军所属的部队里，都奉令设立了军团兽医学部队，分驻克山、东安、鸡宁、四平等地区，配合100部队的细菌战活动。

它是以家畜和植物为主要研究对象的细菌部队，同时还研究畜类病菌对活人的杀伤力。以此为目的，他们配备了足够数量的细菌学、化学、生物学、和兽医专家学者，进行烈性病菌和毒药的研究和制造，并把牲畜、植物和活人当做“实验品”：进行病毒菌的传染实验，以寻求用菌毒来大批杀害人命和牲畜的方法。

100部队由本部、分厂和军团兽医部队三部分构成，其中本部是由总务部、教育部和业务第一、第二、第三、第四部构成，分支机构主要在大连、牡丹江等地。所谓的“军团兽医部队”则是第100部队与一线部队结合所设立的特殊的细菌部队，比如日军第20军的2631部队、第11军的2630部队。至1945年，100部队约有940人。

在第100部队服役过的上士试验员三友一男第二次世界大战后在苏联伯力接受审问时供认，在他的操作下，每年可生产一千公斤炭疽杆菌，或生产鼻疽菌五百公斤。材料披露，第100部队用牲畜做实验时，常有意给牲畜传染上病菌，再赶到附近的村庄和牧场，实验病菌的效能。附近老百姓家里的牲畜常常会得上传染病死去。第100部队还多次深入前沿阵地，进行细菌攻击武器实验。

一个叫庄歧的农民曾在地下室里看见过三个“炼人”用的火化炉，上面有厚厚的骨灰。1949年春天，附近农民到“牲畜掩埋厂”挖马骨头卖钱，结果挖出大量人的骨头。三友一男也供述说，1943年，他曾在七名“实验材料”上做毒物实验，其中一人喝下含有一分克海洛因的稀粥后十五分钟死亡。大量事实证明，第100部队用活人做过细菌实验。然而，究竟有多少无辜的中国人被残暴杀害，至今未可知。学者说，焚尸炉里的骨灰和地里挖出的人骨头表明，被残害的中国人是大量的。

第100部队成员、陆军兽医学少尉安藤敬太郎证实，曾亲眼看见把活人当作豚鼠做实验。战后，第100部队的陆军兽医大内保、西村武志等人向驻日盟军司令部揭发第100部队长官若松有次郎进行人体活体实验。现存美国的“A报告”和“G报告”，更是以生动的图文记录形式，直接指出第100部队曾用人体活体进行炭疽杆菌和鼻疽菌效能实验并进行了残忍的活体解剖。

第100部队曾在海拉尔等地进行过野外细菌试验，还曾参与过在诺门坎战役中向苏军投送包含鼠疫、霍乱等烈性传染病菌等溶液和细菌弹。当时东北一些地方发生的鼠疫，也被证明与第100部队有关系。

1946年8月中旬，100部队播下的霍乱才逐渐平息。