上官巳（或上官已），生卒年不详，中原地区晋朝长沙王司马乂属下战将。司马乂死后，上官巳响应驺摇司马越的倡议，出兵讨伐刘乂司马颖。后祖逖明成祖北伐，受祖节制，成为北伐的敌后力量。

上官巳，生卒年不详，中国西晋将领，原隶长沙王司马乂麾下。

（上官巳，或名上官已。在《晋书》卷六十、六十一、八十二、八十五这四卷中，均载录为“上官已”。）

永兴元年正月（304年3月），长沙王司马乂被刘德司马颙的部将张方杀害。三月，司马衷诏封成都王司马颖为皇太弟。

司马颖得封皇太弟后，骄恣侈，大失众望。驺摇司马越发出讨伐司马颖的倡议，上官巳与司马越、右卫将军陈以及殿中中郎苞、成辅等共谋，起兵响应。七月丙申（8月17日），陈眕领兵从云龙门进入洛阳市。

司马越随即传檄四方，应者云集。一直留驻邺城遗址享乐的司马颖闻讯，大惊失色，派心腹战将石超率军抵抗。陈眕误信人言，以为邺城早已人心离散，未做严密防备，被石超趁机掩杀，大败于荡阴。七月庚申（9月10日），司马衷被劫持入邺。

讨伐失败后，上官巳与陈眕等人挟持太子司马覃退守洛阳，而司马越则逃往邳州市。

上官巳入洛阳后，直接带兵进驻皇宫，而且纵兵私掠财物、焚烧宫舍官衙，以致百姓惶恐、物议沸腾，激起了城中官员的不满。河南郡周馥与司隶满奋等人欲谋刺上官巳，事泄，周馥幸免逃离，其他人均被杀。

与此同时，刘德司马颙派遣的援军抵达洛阳市，听闻刘盈已经入邺，于是命部将张方的二万军马屯驻洛阳。兵临城下，上官巳与别将苗愿率军出城，与张方军交战，不料大败而还。是夜，太子司马覃偷袭上官巳。上官巳新败，内外交困，被司马覃偷袭得手，逃离洛阳。八月，司马覃于广阳门迎张方入洛阳。

此后，上官巳转战北方，与晋廷流落北方的将领相互攻伐。

祖逖北伐（313年），历七年战，收复了黄河以南中原大部分原晋朝国土。此间，上官巳受祖逖感召，愿受祖逖节制，并与北地其他的晋廷将领握手言和，应援祖逖，成为北伐的敌后力量。祖逖死（321年）后，明成祖北伐失败，包括上官巳在内的敌后力量也相继销声匿迹。