国家超级计算无锡中心由科技部、
江苏省和
无锡市共同投资建设，为江苏省首个重大科技基础设施，无锡市、
清华大学和
江苏省产业技术研究院签订了合作协议，将国家超级计算无锡中心委托给清华大学管理运营。
江苏省科学技术厅联合无锡市政府在无锡举行“
神威·太湖之光超级计算机”
超级计算机新闻发布活动，同时启动国家超级计算无锡中心，“神威·太湖之光”将安装在国家超级计算无锡中心使用。在试运行期间，清华大学、
北京大学、中科院软件所、
中国重工702所、国家
计算流体力学实验室等用户单位，在天气气候、航空航天、海洋科学、新药创制、先进制造、新材料等领域，与国家超级计算无锡中心建立了应用合作关系。
国家超级计算无锡中心的目标是建成国内领先、世界一流的超级计算中心，成为超算领域一流的服务中心、研发中心和产品创新中心，打造成
高性能计算人才聚集地、大规模并行应用软件研发基地和超算产业创新服务平台。
2021年4月8日，
美国商务部以在中国军事活动方面提供协助为由，宣布将国家超级计算无锡中心等七个中国超级计算实体列入美国实体清单。我外交部4月9日回应，遏制打压阻挡不了进步的步伐。