2005年6月，经考古发掘，千年古刹遗址重见天日。柳州开元寺的重建得到了信教群众和社会各界的大力支持，广西李宁基金会带头捐款5000多万元人民币。历时两年多，开元寺重建完成。重建后的柳州开元寺占地面积约8.7万平方米，总
建筑面积约2.万平方米。整体寺庙建筑群以唐风为范本，
大雄宝殿全木结构由工程木与传统木相结合，采用榫铆相连接，室内大空间采用穹顶屋盖形式，在中国工程木结构建筑史上实属罕见。柳州开元寺是
广西壮族自治区目前最大的
佛教寺院，是集生态、文化旅游、休闲等多功能为一体的综合性佛教文化观光区。
2012年1月30日，广西最大规模的佛教寺院柳州开元寺在都乐公园重建落成，并举行了盛大落成庆典。
中国佛教协会副秘书长、
广济寺方丈释演觉大和尚，中国佛教协会副会长、
少林寺方丈
释永信大和尚，中国佛教协会常务理事、广西佛教协会会长
释成清大和尚等高僧前来参加庆典仪式。开元寺落成后将免费向市民开放。