生物哲学是研究生物学元理论的跨学科领域，涉及生物学的自然属性和社会内涵两个方面的研究。前者探讨生物学各分支领域的理论基础和形而上学问题，后者则侧重于将生物学成果应用于社会学现象的解释，并涉及生物伦理等问题。

现代生物哲学的形成受到多个重要事件的影响，其中包括查尔斯·达尔文的《物种起源》发表，标志着生物进化理论的出现，以及詹姆斯·杜威·沃森和弗朗西斯·克里克提出的DNA双螺旋模型，开启了分子生物学的时代。Morton Beckner的著作《The Biology way of Thought》也被视为现代生物哲学诞生及方法论讨论的里程碑。

生物哲学的研究内容涵盖了生物学的自然属性和社会内涵两大部分。在自然属性方面，它探索了生物学的基础理论，如目的论与功能主义、还原论与涌现论、进化论、生命的本质、生物模型、生物学中的因果律以及生物学的复杂性。在社会内涵方面，生物哲学关注生物伦理问题，如医学伦理和生物医药伦理、环境伦理，以及进化论对社会科学的影响。

关于生物理论的哲学

1. 普通生物学的哲学基础

（1）目的论与功能主义

（2）还原论与涌现论

（3）进化论

（4）生命的本质

（5）生物模型

（6）生物学中的因果律

（7）生物学的复杂性

2. 各生物学分支的哲学理论

（1）发育生物学的哲学理论

（2）生态环境科学的哲学理论

（3）遗传和分子生物学的哲学理论

（4）系统生物学的哲学理论

3. 与生物相关的交叉科学的哲学讨论

（1）人工生命

（2）生物信息学

（3）生物学史

关于生物的社会学内涵的讨论

1. 生物伦理

（1）医学伦理以及生物医药伦理（Biomedical Ethics）

（2）环境伦理

2. 进化论有关的社会科学领域议题

3. 社会是否可用还原为生物现象

生物哲学的核心议题之一是生物理论的结构，多位学者提出了不同的观点。C.Smart在1963年引发了一场关于生物是否存在类似于物理学定律的争论。此外，因果预测与解释的区别也在生物学中引起了广泛的讨论。还原论作为科学研究中的一个重要概念，也在生物哲学中得到了深入探究。

生物哲学的新发展方向包括语义概念下的生物理论结构研究，复杂系统研究，以及人工生命的研究。人工生命作为一种模拟生命现象的学科，提供了新的理论工具和技术手段，有助于更深入地理解生物学理论。