南京城市足球俱乐部（原名：南京枫帆，英文名：Nanjing City Football Club）是位于中国江苏省的足球俱乐部，原名南京枫帆足球俱乐部，成立于2014年，主场为
南京青奥体育公园体育场，截止2024年1月30日，主教练为
曹睿 。
2017年11月1日，南京枫帆足球俱乐部完成工商注册。随后，被南京市足协在市体育局命名为“少儿足球育才基地”。2019年，南京枫帆参加
中国足球协会会员协会冠军联赛（中冠联赛）。2021年1月17日，南京枫帆足球俱乐部官方宣布，正式更名为南京城市足球俱乐部。2022年4月3日，入选
中国足球协会发布的《2022赛季中国足球协会甲级联赛准入名单》。次年3月29日，中国足协官网公布获得2023赛季职业联赛准入资格俱乐部名单，南京城市足球俱乐部在列。2024年1月29日，
中国足球协会发布通知，南京城市足球俱乐部获得2024赛季职业联赛准入资格。
2014年，南京城市足球俱乐部由江苏枫帆建设集团投资创建，成立初期，俱乐部以校园足球为基础，深耕青少年培训。并以业余球队的身份参加南京市城市联赛、江苏城市业余足球联赛以及南京市足协超级联赛。2017年11月1日，南京枫帆足球俱乐部完成工商注册。随后，在南京市足协在市体育局举行新闻通气会上，被命名为“少儿足球育才基地”。
2018年5月13日，枫帆足球俱乐部以
南京市雨花台中学0102年龄段球员为主参加了2018年南京市足协超级联赛暨2018中国足球协会会员协会冠军联赛。同年，俱乐部和南京大学足球队联合成立了南京枫帆（南大）足球队，11月9日，2019中冠联赛落下帷幕，南京枫帆以总比分5-3战胜了深圳壆岗队，并夺得了冠军。随后，在
南京大学仙林校区的体育场进行了2019中国足球协会会员协会冠军联赛的颁奖仪式。9月11日，俱乐部被
中国足球协会认定为“全国社会足球品牌青训机构（2018-2020）”。
2019年，南京枫帆参加
中国足球协会会员协会冠军联赛（中冠联赛）。在总决赛分区赛中，枫帆队取得了7战全胜的战绩，以21分满分的成绩排名北区第一，获得
中国足球协会乙级联赛优先准入资格。随后江苏枫帆建设集团开始加大投入，投资人赵志刚也向俱乐部提出了“一年上
中国足球协会乙级联赛、三年到
中国足球协会甲级联赛、五年进
中国足球协会超级联赛”的目标。
2021年1月17日，南京枫帆足球俱乐部官方宣布，正式更名为南京城市足球俱乐部。4月14日，南京城市队官方宣布
邹利、
郑雪健、
张劲一、
谢志伟、
孟振、
梁景博、李亮亮、
李家伟、
黄子豪、
胡书铭共10名球员加盟球队。4月15日，
2015年中国足球甲级联赛南京城市官方消息，
周佳豪、
钟屹、
张新林、
王小乐、
王大龙、
孙凝喆、
牟善韬、
李锐、
姜灏、
戈伟、
储今朝、
陈方舟、
曹海清、
阿不都撒拉木等14名球员即日起正式加盟球队。4月16日，经与所在俱乐部协商，并与球员本人达成一致：
梅西·保利、
孙恩明、
吴雷、
徐继祖、
赵鸣宇即日起租借加盟南京城市足球俱乐部，
谭宾凉、
韦健即日起正式加盟南京城市足球俱乐部。4月18日，
中国足球协会甲级联赛球队南京城市官方宣布，前江苏苏宁青训总监皮亚担任球队主教练。7月11日，南京城市队主帅皮亚携队员梅西·保利出席了赛前新闻发布会。同日下午，球队官宣新援
陶源加盟。
2022年4月3日，南京城市足球俱乐部入选
中国足球协会发布的《2022赛季中国足球协会甲级联赛准入名单》。4月15日，中甲南京城市足球俱乐部官方宣布，
塞尔维亚中后场多面手内马尼亚-维迪奇正式加盟球队。4月28日，
中国足球协会甲级联赛南京城市足球俱乐部官方宣布，球员
辛巴耶夫即日起正式加盟。次日，南京城市官方宣布，经与球员本人达成一致，
赵鸣宇、
倪寅、
陈泽鹏、曹朕铨、
张子民等5名球员，正式加盟球队。5月，南京城市足球俱乐部通过官方公众号，公布了球队的新队徽。同月，中甲南京城市足球俱乐部宣布，球队门将
韦健正式退役告别赛场。6月6日，三名原
重庆两江竞技足球俱乐部球员
邓宇彪、
朱佳毅和
杨朝辉加盟中甲南京城市。10月8日，南京城市队官宣：
奥斯卡·卡贝萨担任一线队主帅。
2023年3月29日，
中国足球协会官网公布获得2023赛季职业联赛准入资格俱乐部名单，南京城市足球俱乐部在列。4月5日，中国台北籍球员殷亚吉加盟南京城市足球俱乐部。4月7日，中国足球协会发布获得2023赛季中甲联赛参赛资格的俱乐部名单，南京城市足球俱乐部在列。7月1日，前南通支云外援阿卜杜·特拉奥雷加盟南京城市。随后
中国足球协会甲级联赛南京城市官方宣布，蒋哲、张天龙加盟球队。7月17日，南京城市俱乐部官方宣布，渠成正式加盟球队。随后，经与南京城市足球俱乐部友好协商，球员杨朝辉正式租借加盟上海嘉定汇龙足球俱乐部。7月31日，经与成都蓉城足球俱乐部及球员本人协商一致，球员韩轩正式租借加盟南京城市足球俱乐部。
2024年1月5日，南京城市外援杰弗森·达席尔瓦加盟玻利维亚球队。1月29日，
中国足球协会发布通知，南京城市足球俱乐部获得2024赛季职业联赛准入资格。2月28日，
中国足球协会甲级联赛南京城市俱乐部官方宣布，正式签下 21 岁的广州队队长
凌杰，凌杰加盟南京城市的方式为免签加盟。6月23日，
足协杯赛第4轮，南京城市对战
沧州雄狮足球俱乐部。第64分钟，南京城市打破僵局，奥格布传中，黄振飞近距离头球破门，南京城市1-0领先沧州雄狮。最终，南京城市1-0击败沧州雄狮，晋级足协杯16强。8月21日，在2024赛季中国足球协会杯四分之一决赛中，南京城市主场1-2不敌
成都蓉城足球俱乐部队，止步足协杯八强。10月13日，
中国足球协会甲级联赛第27轮，南京城市0-2不敌大连英博。
2025年1月6日，南京城市足球俱乐部获得2025赛季
中国足球协会职业联赛准入资格。
2023年3月13日，
中国足球协会关于公示第一批完成
债务清欠俱乐部名单的通知，南京城市足球俱乐部在列。2024年12月2日，中国足球协会对2025赛季职业联赛准入第一批完成债务清偿俱乐部名单进行公示，南京城市足球俱乐部未在名单之中。12月20日，
中国足球协会对2025赛季第二批完成足球行业内债务清偿俱乐部名单进行公示，南京城市足球俱乐部在列。