该作是根据
日本漫画家
岸本齐史的热血动漫《
火影忍者》所改编的游戏，该作讲述了从五影会谈到第四次忍界大战爆发的所有剧情。
《火影忍者疾风传：究极忍者风暴3》所收录的剧情从六道培因一战结束之后的五影会议开始，一直到第四次
忍界大战结束。
玩家将能够完整体验原作中各种如
漩涡鸣人vs
尾兽与面具男、五影vs
宇智波带土等等的名场面，此外也有根据玩家的选择而触发如鸣人vs佐助等原创剧情。
游戏中登场的角色均来自原著《
火影忍者》漫画中的人物，在该游戏中一共可操作角色87名。与前作《火影忍者：究极忍者风暴2》相比增加了14名新的角色：
玩家在选择角色后可以进行一次场景选择，场景地图可以任意选择，没有限制。在某些场景地图中，玩家可以对场景进行一些破坏，部分场景存在深渊地形，掉下深渊的话，会受到伤害。
游戏中的场景地图均来自原著《
火影忍者》漫画和动画中的场景，如木叶村、云隐村、雾隐村还有一些荒凉的野外场景。
在剧情模式中，玩家必须要操控主角
漩涡鸣人在广大的忍者世界中四处冒险，例如在原作中无法一窥其全貌的木叶忍者村，在游戏中就能够尽情探索。而随着剧情的发展，玩家将会在关键时刻面临不同的抉择。
游戏中分有序章：
九尾来袭、第一章：五影会谈、第二章：第七班重聚、第三章：两个人柱力、第四章：鸣人的诞生、第五章：暗中活跃着、第六章：开战、第七章：致命的海湾战、第八章：两个太阳、第九章：影的战斗、第十章：通往和平之路、断章：永恒万花筒和真·断章：宇智波兄弟，共计十一大章和两断章。
《火影忍者疾风传：究极忍者风暴3》是一款综合素质极高的漫画改编游戏，很好展现了作品魅力。游戏的场景、人设、招式还原度极高，剧情贴合原作又有良好发挥。不过战斗系统还有待改进的空间。（
游民星空评）
游戏中角色动作的流畅度、人物模组与背景图像的整合以及宛如动画一般的光影表现。但是为了完全重现原作剧情，过场动画份量非常多，也因此稍微破坏了游戏的节奏感，不过毕竟是粉丝向的游戏要求不能太高。（游侠评）