秦仁昌（1898年1月16日—1986年7月22日），男，江苏省武进区人，是植物学家，曾当选中国科学院院士。

秦仁昌1925年本科毕业于金陵大学林学系。1926年到1927年担任中央大学理学院生物系植物学讲师。1927年起担任中央研究院自然历史博物馆植物学技师。1955年当选中国科学院学部委员（院士）。1956年担任中国科学院植物研究所研究员兼植物分类与植物地理学研究室主任。1986年7月22日因病去世，享年88岁。

秦仁昌从事蕨类植物学研究60年。是中国蕨类植物学的奠基人，中国“蕨类学之父”。出版了《中国蕨类科属名词及分类系统》《水龙骨科的自然分类》《中国蕨类植物图鉴》等著作。建立了一个完整的中国蕨类植物系统。把100多年来囊括蕨类植物80%的属和90%种的混杂的“水龙骨科”划分为33个科249个属，清晰地显示出了它们之间的演化关系，使中国的分类学研究从单纯的标本观察扩大到形态、解剖、孢粉、细胞、生态、植物地理、古植物和栽培利用等多学科的综合研究。研究成果先后获中国科学院自然科学奖一等奖、国家自然科学奖一等奖。

1898年1月16日，秦仁昌出生于武进区的一个农民家庭。1914年考入江苏省第一甲种农业学校林科学习，在该学校立志学习植物分类学。1919年从江苏省第一甲种农业学校毕业后，考入金陵大学林学系半工半读，期间于1924年到1925年担任东南大学理学院生物系植物学助教。

1925年毕业于金陵大学林学系，获学士。1926年到1927年担任中央大学理学院生物系植物学讲师。1927年起担任中央研究院自然历史博物馆植物学技师。1929年到1932年前往丹麦哥本哈根大学植物学博物馆进修考察，师从蕨类植物学权威C.科利斯登生(Christensen)，开展蕨类植物分类学的研究，期间访问了瑞典、德国、法国、奥地利和捷克斯洛伐克的标本馆，在丘园标本馆、大英自然历史博物馆工作。1930年代表中央研究院自然历史博物馆参加第五届国际植物学会，回到中国后担任静生生物调查所研究员兼植物标本室主任。

1933年与其他专家一起发起成立了中国植物学会，并担任中国植物学会副理事长。1934年创建中国第一个植物园—庐山植物园并担任主任。1938年到1946年担任庐山森林植物园丽江工作站主任。

中国抗日战争期间在云南省创建了静生生物调查所云南丽江植物工作站并担任主任。1945年，受聘为云南大学生物系和林学系教授兼主任，期间对云南省农林业方面的发展提出了许多良好的建议。1948年到1950年期间担任云南省建设厅农业改进所所长。1949年后兼任云南省林业局副局长，领导并计划了云南省金鸡纳和橡胶宜林地勘察及育苗造林工作。

1955年当选中国科学院学部委员（院士）。1956年担任中国科学院植物研究所研究员兼植物分类与植物地理学研究室主任，利用中国科学院植物研究所丰富的标本和图书等条件，将蕨类植物的研究中心转移到了北京市，对中国的蕨类植物研究的发展作了部署。1958年起担任新疆综合考察队植物组组长，并前往新疆进行考察。1959年被选为中国植物志编委会委员兼秘书长，在协助下出版了《中国植物志》(第二卷)。

“文化大革命”期间，虽受到了冲击，但他没有停止蕨类植物的研究工作。1978年发表了《中国蕨类植物科属的系统排列和历史来源》重要论文。1983年还和年轻同事完成了《西藏植物志》中的蕨类植物志的工作。

1986年7月22日，秦仁昌在北京因病去世，享年88岁。

1940年以前，蕨类植物的分类系统受到英国植物学家罗伯特·胡克保守分类系统的影响近1个世纪，一些庞杂的科、属概念得不到澄清，极大阻碍了该学科的发展。秦仁昌对当时包括有全世界1万多种的“水龙骨科”进行了研究，1940年发表了论文《水龙骨科的自然分类》，把100多年来囊括蕨类植物80%的属和90%种的混杂的“水龙骨科”划分为了33个科249个属，清晰地显示出植物间的演化关系，解决了当时蕨类植物学中难度最大的课题，在世界蕨类植物系统分类发展史上做出了重大突破，被称为“秦仁昌系统”，后国际上出现了众多新的分类系统，这些新分类系统或多或少地受到秦仁昌系统的影响，有的仅仅是该系统的补充。1954年秦仁昌又建立了一个完整的中国蕨类植物系统。1959年，秦仁昌被选为《中国植物志》编委会委员兼秘书长，开始开展《中国植物志》编写工作，1959年编辑出版的《中国植物志》(第二卷》，是《中国植物志》这部历史性巨著的第一本，为其他卷册的编写起了典范作用，对发展中国和世界的植物系统学作出了重要贡献。

秦仁昌共发表论文160多篇，截至2023年4月，中国知网下载量达2906，以下为最高被引的10篇论文。

秦仁昌共出版专著和翻译书15本。其中《中国蕨类植物志初稿》是中国人研究蕨类植物最早的两本专著之一。

秦仁昌的研究成果先后获中国科学院自然科学奖一等奖、国家自然科学奖一等奖。

秦仁昌曾为技术人员辅导植物学理论、研究方法、拉丁文和英文等课程，培养了不少林业和植物学人才。翻译了《植物学拉丁文》一书，编译了《现代科技辞典》和《大不列颠百科全书》中的植物学部分，组织和审改了《韦氏大辞典》植物学部分的译稿供青年学者使用。代表性学生有中国科学院昆明植物研究所研究员武素功。

秦仁昌塑像位于仙湖植物园。

秦仁昌院士诞辰120周年学术研讨会于2018年9月在南京林业大学召开，由挂靠于中科院植物所的中国花卉协会蕨类植物分会、中国野生植物保护协会蕨类植物保育委员会和中国植物学会蕨类植物专业委员会（筹）主办，南京林业大学和江苏省中科院植物所（南京中山植物园）联合承办。

金陵大学学习期间的老师陈焕镛在1927年发表的秦氏紫荆，嵌入了秦仁昌的姓氏。

秦蕨属是英国蕨类植物学家霍尔通为纪念秦仁昌，以秦姓命名的金星蕨科植株最为高大的一个属。

《云南大学学报(自然科学版)》表示：“他（秦仁昌）对中国的科学事业做出了卓越的贡献。”

张宪春以“蕨类植物学之父，中国植物分类学的拓荒者”高度评价秦仁昌。

国际蕨类学会主席亨尼普曼在纪念秦仁昌诞辰90周年大会上表示：“秦仁昌不仅是中国蕨类学之父，也是世界蕨类学之父。”