余杭塘河古称“运粮河”，又名“官塘河”，流经
余杭街道、
仓前镇、五常街道至
杭州市，汇入
京杭大运河，全长19.8公里。余杭塘河在历史上
商船云集、
航运发达，反映了以漕运文化为中心，并随其发展而来的治水文化、商贸文化乃至建筑文化，是记载杭州历史变迁的重要组成部分。
隋大业间（605年～618年），余杭塘河为漕运而疏浚，是古代余杭县主要航道之一。清嘉庆《
余杭县志》记载“余杭塘河在县东南二里，阔三十步深一丈许，连南渠河，自安
乐桥四十五里至杭州之运河”。余杭塘河上游为南渠河。宋时南渠河西通木竹河，从石门塘达洞霄宫。下游经长桥，东流约七里而至
灭渡桥，折东南流约十二里，至观音桥又东流约一里，至
卖鱼桥，与下塘河会。古时，
临安区、於潜等地竹木山货经木竹河至
余杭区集散。
余杭塘河“通舟，水盈可胜三百以上舟，迁旱水涸亦可胜百斛舟”。元
至正十九年（1359年），
张士诚自武林港至
江涨桥新开运河，使余杭塘河与
京杭大运河直线沟通，提高了余杭塘河的航道作用。清康熙二十三年（1684年），选石筑余杭东关至文昌阁堤塘于道左。翌年疏浚，上及石门，疏南渠河之浅阻以通商舟，开木竹河之湮淤以溉田。至民国二十二年（1933年），航道宽度达4米，可通小船。
抗日战争胜利后，由于余杭港埠物资集散量增加，较大吨位的
木帆船陆续驶抵余杭，古航道
卖鱼桥段河道狭窄，时碍航行，除航船和小吨位船舶继续行驶观音桥、卖鱼桥航线外，航道走向改由余杭经仓前、女儿桥至杨家桥，北折过杨家桥绕三墩文星阁，东向经
祥符桥，东南出小河惠安桥至大关桥进入运河。
公元1247年，
南宋淳祐七年，
杭州市大旱，
西湖见底，百井干涸。为解决京城百姓吃水难问题，朝庭上马了一项“引天目水工程”：通过
余杭区塘河，将
浙江天目山上的来水，从余杭，引到
八字桥，再从八字桥凿渠直通
西湖。注入西湖的天目水经地下涵管，流入
临安区。
100年后，元朝末年，为了便于军粮运输，吴王
张士诚率20万军民，历时十年，从江涨桥（信义坊通往杭办大厦之间的那座桥）到塘栖，挖了一条“宽二十丈”的新运河，新运河在北端与余杭塘河相连，南端连接
隋炀帝开凿的
江南运河。自此，产自
余杭街道、
仓前镇、
蒋村乡的大米和其他土特产，经余杭塘河、
京杭大运河，源源不断运往北方，余杭塘河也因此被称为“运粮河”。
在《杭州市河道交通航运规划》中指出杭州未来的水上公交线主要有9条，而其中有2条经过余杭塘河，并且在《余杭组团分区规划》、《余杭创新基地总体规划》中也对
水上巴士作了相应的规划，将实现余杭塘河与杭州主城区以及创新基地内部的贯通。近年来，由于余杭塘河沿岸及周边分布了不少诸如热电厂、
水泥厂、塑料厂等工业企业，对河道生态环境造成了一定的影响和破坏。为此，区规划分局已委托中国联合工程公司正在抓紧编制《余杭塘河综合整治规划》。同时，在组团分区规划与创新基地总体规划中对现状沿岸周边以污染型工业用地为主的用地分布作了调整，并对沿河两岸的绿化要求作了规定。
2008年，航行在杭余线的船舶约96艘，1.9万吨位。杭余线航道两岸有码头18家，泊位点长3134米，泊位51个，船舶最大泊靠能力为300吨级。余杭港埠主要出港货物为
非金属矿石、石料，进港货物为煤炭、黄沙、
石膏及
水泥厂用矿石等。是年9月，
杭州市开通武林门至西溪（五常港）
水上巴士。杭余线航道实施白天通行水上巴士、夜间通行
货船的管控通行方案。2009年7月1日起，杭余线航道禁止货船通行，关停沿线
余杭区组团18家码头。余杭区政府补助常年在杭余线上航行的78艘货物运输船舶转移经营。杭余线航道实现客货船通行向
客船通行过渡，成为水上旅游专线。
上行：信义坊站-大关站(大关桥)-和睦站-古翠站-古墩站-
浙大紫金港站蒋村站-西溪站