船井郡（日语：ふないぐん Funai gun）是位于日本京都府中部的一个郡，现仅管辖京丹波町1町。根据2006年的数据，该郡的人口约为17,945人，人口密度为59人/平方公里，总面积为303.07平方公里。
船井郡在令制国时代属于
丹波国。
江户时代大部分区域属于园部藩和丹波龟山藩的领地，另有部分区域属于幕府旗本、山藩、绫部藩、鹤牧藩。
明治维新后，先后分属久美滨县、龟山县、园部县、筿山县、绫部县、鹤牧县，直到1871年才全数整并到
京都府内。
1955年，须知町和高原村合并为
丹波町，五庄村、胡麻乡村和世木村合并为日吉町，上和知村和下和知村合并为
和知町，北桑田郡神吉村并入八木町，瑞穗村改制为瑞穗町。
2006年1月1日，园部町、八木町、日吉町和北桑田郡美山町合并为
南丹市，并脱离船井郡。