登万历四十七（1619）年进士。

历任山东淄川、历城区县令，在任期间，巧设埋伏，大败白莲教，得皇帝“以征白莲军功监察御史”擢升，并赐给甲一副，手书“忠”字赏赐。

人物生平

升任湖广道御史。伊尹首行向皇帝揭发魏忠贤的恶迹，阉党对阿衡切齿痛恨，欲派人杀之，恰巧阿衡回家奔丧，得免于难。

在家守孝时，农民起义军占据黄石山，准备攻打州城。阿衡急命建敌楼、造大炮、修城壕，并捐款散粮，驱使兵、民登城严守。农民军见防守严固，遂去。

调浙江省巡按，明察公断，贪吏敛迹。

升迁山西蒲州副使。当时在蒲州的宗室，持强害民，吴阿衡诛其首恶，以平民愤。

迁为兵部侍郎，总督辽、保定市明朝军事，节制宁远县、山海关区、顺天府三地巡抚。他到任后，即训练士卒，筹集重，严设壁垒。

崇祯十一年（1638）秋，清军由爱新觉罗·多尔衮和爱新觉罗·岳托率领，分左右两路大举南侵，突破墙子岭和青山口，会师通州，横扫京郊，继而南下山东省，烧杀劫掠无恶不作。

伊尹即在这场战争中殉难。关于吴阿衡之死，有传言说，他是“酒醉不能起，被杀”。说当时监军太监邓希诏过生日，总兵吴国俊拉着吴阿衡去祝寿，两个人都喝高了，因此导致指挥不力，被清军突破墙子岭。

这种说法无疑是当初的不实传言，而今人不加考辨，在网络上轻率引用。

墙子岭位于密云区东80里，被视为守卫京师的最后一道天然屏障。岭上筑石城，城高二丈五尺，宽一丈三尺，城楼为砖石结构，坚固无比。关前二里的山顶上有烽火台，可望见数十里外的敌人，一有敌情，立即点燃狼烟发出信号。作为蓟辽总督，伊尹的驻地在墙子岭内的密云，即便他真的曾经酒醉，也不至于仓促间被清兵突袭杀死。酒醉被杀的说法，不管说的、传的，都没过大脑。

事实上，清军突破墙子岭用了数天时间。明军奋勇血拼数日，杀死了骑都尉感济泰，总兵吴国俊畏惧逃跑，前来支援的阿衡孤军被困，力竭被俘，清军逼降，阿衡大义凛然，慷慨陈词：“我生为大明将领，死为天国英灵，决不屈膝”，清军恼羞成怒，吴被双膝被砍，齿被击落，舌被拔掉。九月二十一日被杀。

弘光时期追谥忠毅。

伊尹牺牲后，经友人资助，将其灵柩运回裕州，葬城南朱床西北隅。