复旦大学附属上海市第五人民医院是一所综合性大学附属医院。医院前身为1904年英国人创建的“西人隔离医院”，1945年收归国有，1960年，医院整体搬迁至闵行区鹤庆路。2010年12月，医院通过三级乙等综合性医院评审。2018年5月，医院正式成为“上海市红十字第五人民医院”。

早在1948年，医院就与原国立上海医学院签订教学协议，1961年成为原复旦大学上海医学院的临床教学基地。1989年，经上海市教委、上海市卫生局和上海医科大学再次认定为原上海医科大学教学医院。1998年9月，闵行区人民政府和原上海医科大学正式签订区校共建协议。2004年10月，经上海市卫生局和上海市教委考核后批准，医院正式成为复旦大学附属医院。2020年9月，医院被评为上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体。

1904年7月，英国人在旧公共租界工部局管辖区建立“西人隔离医院”。

1937年12月，日本同仁会华中支部接管医院，改称为“同仁会上海医院”。

1945年10月，中国抗日战争胜利后，医院改名为“上海市立第五医院”。

1949年7月，上海解放后，医院改称为“上海市第五人民医院”。

1960年2月，根据上海市政府决定，医院迁址闵行区，院名为“上海市闵行区中心医院”，院址闵行区鹤庆路221号。

1964年，闵行区并入徐汇区，医院改称为“上海市闵行医院”，定为区级中心医院。

1966年，文化大革命开始，医院改称为“上海市工农医院”。

1984年11月，医院恢复“上海市第五人民医院”名称。

1994年12月，医院被上海市卫生局审定为二级甲等医院。

1995年，闵行区传染病医院并入上海市第五人民医院。

1998年，闵行区政府和国立上海医学院签订区校共建上海市第五人民医院协议。

2004年10月，医院正式成为复旦大学附属医院，同时，闵行区人民政府与复旦大学签订第二轮合作共建上海市第五人民医院协议。

2004年起，医院开始独立招收培养复旦大学临床医学硕士、博士研究生。

2010年9月，闵行区人民政府与复旦大学签订第三轮合作共建上海市第五人民医院协议。

2010年12月，经上海市医院综合评价（评审）中心组织评审，上海市卫生局认定，上海市第五人民医院成为三级乙等综合性医院。

2016年4月，复旦大学附属华山医院与闵行区卫计委、市五医院签订三方合作框架协议，“华山-五院-闵行”医疗联合体正式成立。借助复旦大学医学学科人才、科研优势，并充分利用医疗联合体平台优势资源，通过整合多方资源，不断推进大学科建设，促进医院发展，增强核心竞争力。经过2年多的建设，医院引进学科带头人和聘请华山医院学术主任、特聘教授等，不断提升医院的诊疗水平、诊疗难度，医院病例组合指数（CMI）达到1.15，身全市同级别医院前列。同时，医院被中国卒中学会、中国卒中中心联盟授牌全国第二批“综合卒中中心”。 

2017年4月，获批成立复旦大学社区健康研究中心（筹）。

2018年5月，获批冠名“上海市红十字第五人民医院”。

2020年3月，上海市第五人民医院获得互联网医院牌照，是上海市首批开展互联网医疗服务的公立医院之一。

医院现有38个临床医技科室，泌尿外科、神经内科、内分泌科先后被列入上海市医学重点专科；小儿科列入上海卫生计生系统重要薄弱学科建设计划；肾内科（糖尿病肾病）列入上海市中西医结合重点病种建设项目；中医科（肺病科）列入上海市中医临床优势专科（专病）建设项目；老年护理列入复旦大学临床护理特色专科建设项目；呼吸内科、骨科、病理科、创伤-急救-危重症医学中心等7个学科列入复旦大学“医院优势学科建设项目”；普外科和神经内科列入闵行区医疗系统大学科建设；妇产科、胃肠结直肠外科、神经外科和放射科等9个专科列入闵行区医学特色专科建设。医院为全国综合性医院中医药工作示范单位。