该片用散点透视的方法，把鲁迅生命最后三年中的重要事件一一呈现，其中包括与瞿秋白的交往、参加
杨杏佛的追悼会、与
萧红萧军的会面等。其中夹叙了与瞿秋白交往、参加杨杏佛追悼会、与萧红和萧军会面等事件的故事，于2005年首映。
颓唐潦倒的
孔乙己，可悲可恨的
阿Q，痴语癫狂的狂人，命途多的
祥林嫂……沿着桨声水影的绍兴河，伴着咿咿呀呀的社戏声，反复出现在作家鲁迅的梦中。终其一生，他的笔，似乎总在书写着同一个梦。枣树，
小菜蛾和粉红花。
一九三二年的
北京师范大学操场，面对着一张张青春飞扬的脸庞，鲁迅依稀间看到了
刘和珍们的容颜，他大声疾呼道，真正的知识阶级，应该独立、应该永远“不合时宜”。这个精神界的斗士，时时要“横眉冷对千夫指”，却不忘“俯首甘为孺子牛”。一九三三年，鲁迅携
许广平回到
上海市。这时的上海危机四伏。丁玲、
潘梓年被特务绑架，应修年遇难。白色恐怖的火焰，发誓要使鲁迅这个名字像被焚化的书页一样，灰飞烟灭。鲁迅却将这一张自己名字赫然在目的黑名单信手拂去，帮助瞿秋白夫妇和
冯雪峰避难，又以民权会成员的身份，同
蔡元培、宋庆龄和
杨杏佛等一起发表了《文化界为营救丁潘宣言》。装着子弹的信封、便衣特务的跟踪车，鲁迅明知身后有瞄准自己的枪口，担心的却是革命青年的安危。清晨，杨杏佛在车内被刺，身中数弹。
《鲁迅》由现实与梦境两部分虚实结合而成。影片选取了鲁迅最后3年的生活，在这3年中，3场死亡成了一个内在结构：杨杏佛之死、瞿秋白之死与鲁迅之死，其中夹叙了与瞿秋白交往、参加杨杏佛追悼会、与
萧红和
萧军会面等事件，这是影片“实”的部分。在这部分中，鲁迅的生活情景以真实为前提，无论是服装、道具还是群众演员的发型，影片均自然再现了上世纪30年代
上海市的真实情景。
求真求实意味着要求形象的逼真。对
濮存昕而言，像不像鲁迅，这是开拍前面临的最大问题。没试妆前，存昕自己也没底，但当造型师将鲁迅标志性的胡子和头发往濮存昕脸上一贴、把他的双眼皮贴成斜三角的单眼皮、眼袋加厚眉骨垫高，将10套零部件分14个步骤进行组装、花了3个小时打造出来的“鲁迅”一照镜子，濮存昕的信心顿时有了。而影片中鲁迅烟卷不离手、硬得竖起的头发、爱好喝酒喝茶等诸多细节，拍摄前均曾经过仔细的考证。
虚的部分是指全片中的7个梦境。鲁迅经常做梦，也喜欢谈梦、写梦，在他的著作中，梦与
幻觉的出现不下几十次。在片中，编导通过梦境把鲁迅内心的爱与痛外化成可以看见的影像，让观众与鲁迅一起感受他的爱与痛、惊与悲。于是，颓唐潦倒的
孔乙己、可悲可恨的
阿Q、痴语癫狂的狂人、命途多舛的
祥林嫂、社戏中咿咿呀呀的女吊，这些鲁迅作品中的经典形象出现在了鲁迅的梦与幻觉中。而最后仅凭一己之力架住闸门、让困在铁屋里的人逃离牢笼的高大形象，成了鲁迅自己一生的写照。