哈尔滨市儿童医院（又名：黑龙江省儿童医疗中心），创建于1955年，是一所集医疗教学、科研预防、急救康复为一体的一所大型综合性三级甲等儿童专科医院。地址位于道里区友谊路57号。院长为孙新刚。

哈尔滨市儿童医院占地面积30800平方米，建筑面积68974平方米，编制床位900张。以儿内外科、急诊急救为主体，拥有33个专业和临床科室，22个医技科室。1975年，哈尔滨市儿童医院成立呼吸内科。1997年，哈尔滨市儿童医院成立哮喘专业门诊。2004年，哈尔滨市儿童医院成立变态反应科。次年，哈尔滨市儿童医院成立了黑龙江省第一家儿童过敏性疾病免疫治疗中心。2010年，哈尔滨市儿童医院成立门诊呼吸雾化治疗室，2013年，哈尔滨市儿童医院成立电子支气管镜室。

2018年，哈尔滨市儿童医院变态反应科被中华医学会变态反应分会儿童过敏和哮喘学组、中华医学会小儿科分会呼吸学组哮喘协作组授予“儿童哮喘标准化门诊示范中心”。

哈尔滨市儿童医院创建于1955年。1975年，哈尔滨市儿童医院成立呼吸内科。1997年，哈尔滨市儿童医院成立哮喘专业门诊。2001年，哈尔滨市儿童医院成立青春期医学专科。同年，哈尔滨市儿童医院成立消化腔镜室。2004年，哈尔滨市儿童医院成立变态反应科。次年，哈尔滨市儿童医院成立了黑龙江省第一家儿童过敏性疾病免疫治疗中心。2010年，哈尔滨市儿童医院成立门诊呼吸雾化治疗室，2013年，哈尔滨市儿童医院成立电子支气管镜室。

哈尔滨市儿童医院占地面积30800平方米，建筑面积68974平方米，编制床位900张。年均门急诊量近80万人次，年住院病人超4万人次，年手术病人8000余人次。医院有1个黑龙江省领军人才梯队、3个哈尔滨市重点领军人才梯队、3个哈尔滨市领军人才梯队、4个局级领军人才梯队。

哈尔滨市儿童医院以儿内外科、急诊急救为主体，拥有33个专业和临床科室，22个医技科室。

哈尔滨市儿童医院配备顶级GE256排512层超高端螺旋CT、3.0T高场磁共振、全数字多普勒超声诊断仪、血透机、体外循环机、高压氧舱、各类检验生化设备以及现代化的层流调温手术室，其中有百级净化、正负压切换手术间8间。

哈尔滨市儿童医院呼吸内科成立于1975年，是黑龙江省惟一独立的小儿呼吸专科。设有病房、专科门诊以及特诊，形成具有一定专业水准的现代化诊疗体系，承担黑龙江省及周边地区儿童呼吸系统疾病的防治工作。1997年，成立哮喘专业门诊，2010年，成立门诊呼吸雾化治疗室，2013年，成立电子支气管镜室。呼吸一科有主任医师2人、副主任医师3人、主治医师2人、住院医师3人，其中硕士5人。以及副主任护师1人、主管护师1人、护师7人、护士2人。设立床位60张，以及肺功能仪、纤维支气管镜、超声雾化泵、输液泵、心电血氧监护仪等医疗设备。并设有肺功能室、纤维支气管镜室及雾化治疗室等。

该科室专业包括小儿呼吸系统常见病、多发病的诊断、治疗，如反复呼吸道感染、小儿气管炎、新生儿肺炎、支气管哮喘、毛细支气管炎、肺不张等的诊治；小儿呼吸系统疑难病症的诊断及治疗，如闭塞性毛细支气管炎、特发性肺纤维化肺泡炎、类脂性肺炎、肺发育不良、胸部肿瘤、囊肿、咯血等。

2004年，哈尔滨市儿童医院成立变态反应科。次年，哈尔滨市儿童医院成立了黑龙江省第一家儿童过敏性疾病免疫治疗中心。作为黑龙江省儿科领域首家变态反应专科门诊，也是黑龙江省第一家集检查、诊断、治疗为一体的治疗儿童变态反应疾病（即过敏性疾病）的特色科室。科室担负着黑龙江省及周边地区儿童过敏性疾病的诊治工作。现有2名主任医师，1名副主任护师，2名主管护师和1名护师。学科带头人为黑龙江省变态反应专业委员会的主任委员，同时兼任中华医学会变态反应分会，中国医师协会变态反应分会委员。

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2019年2月1日，哈尔滨市儿童医院张旭光博士在出站答辩会上向哈尔滨医科大学的5位考核专家汇报了研究成果，并得到专家高度的认可。张旭光博士利用三年时间完成《维生素D、A水平与黑龙江省儿童反复呼吸道感染以及川崎病相关性的研究》，本研究为黑龙江省儿童科学补充脂溶性维生素提供了更多的理论依据。

哈尔滨市儿童医院有1个市级小儿科研究所；1个博士后科研工作站；9个基地：卫生部临床药师培训基地，中华放射学会东北三省儿科影像基地，全国小儿麻醉第二批培训基地，美国儿科学会中国教育基地，黑龙江省儿科急诊急救基地，黑龙江省博士后创新创业实践基地，黑龙江省儿童眼保健、口腔、听力、青春期培训基地，美国心脏协会心血管急救培训基地，国家级儿科、儿外科住院医师规范化培训基地；8个中心：黑龙江省儿童医疗中心、黑龙江省新生儿科医疗质量控制中心、黑龙江省小儿消化科医疗质量控制中心、哈尔滨市儿内科医疗质量控制中心、哈尔滨市儿外科医疗质量控制中心、美国微笑联盟•哈尔滨市儿童医院唇腭裂治疗中心、黑龙江省危重症新生儿救治中心、黑龙江省儿童血友病诊疗中心。

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2018年，哈尔滨市儿童医院变态反应科被中华医学会变态反应分会儿童过敏和哮喘学组、中华医学会小儿科分会呼吸学组哮喘协作组授予“儿童哮喘标准化门诊示范中心”。

哈尔滨市儿童医院“爱心礼物”救助基金、美国微笑列车唇腭裂免费救治项目、黑龙江省青基会“益起来‘心’希望先心病公益项目、黑龙江省慈善总会“启声儿童听力筛查公益慈善项目”、黑龙江省计划生育协会“幸福微笑”唇腭裂儿童免费整形公益项目、哈尔滨市慈善总会“护童基金”脑瘫救助和先心病救助项目、哈尔滨市红十字会唇腭裂免费救治惠民行动、香港特别行政区韩世灏博士儿童先心病基金等23个慈善公益项目，救助贫困患儿1.5万余名。

2023年6月，黑龙江省哈尔滨市巴彦县一医院大厅地上有一婴儿，引发关注。巴彦县卫生健康局9日通过其官方微信公众号发布情况通报称，6月8日早8时10分，25岁孕妇徐某某，在其丈夫的陪同下到巴彦县人民医院就诊。在到达门诊大厅时出现腹痛症状，丈夫将其抱起时，胎儿自动娩出。大厅工作人员发现后联系了妇产科医生。随后，妇产科学医生将产妇徐某某护送至产科进行治疗，急诊科护士将婴儿转至急救室。经会诊，该婴儿为早产，为使其得到更有效的治疗，由县120救护车紧急护送转运至哈尔滨市儿童医院进行治疗，产妇徐某某在县人民医院住院治疗。