三元镇位于重庆市丰都县北部，东与保合镇接壤，东南与保合镇接壤，南与仁沙镇毗邻，西南与垫江县裴兴乡相接，西与许明寺镇相连，西北与董家镇接壤，北与双龙镇相邻，东北与保合镇、双龙镇相接。镇政府驻地距离丰都县政府驻地59千米，总面积为77.02平方千米。

民国二十年（1931年），建三元乡。

1958年，三元乡改为三元公社。

1983年，三元公社改为三元乡。

1992年，三元乡与乐家乡合并建三元镇。

三元镇地势高低起伏，地形以丘陵、浅沟交错为主；主要山脉有黄草山，境内最高峰凉山磴位于青杠垭村境内，海拔1260米；最低点渠溪河位于滩山坝境内，海拔240米。

三元镇属亚热带季风气候，其特点是气候温和、降水充沛、四季分明、季风明显及立体气候明显；多年平均气温19℃，1月平均气温7℃，7月平均气温37.3℃，平均气温年较差36℃；生长期年平均120天，无霜期年平均300天；年平均日照时数1259.5小时，年总辐射80.1千卡/平方厘米；年平均降水量1080毫米，年平均降水日数为52天；降雨集中在每年8—10月，9月最多。

三元镇境内河道属渠溪河流域；有四级河渠溪河1条，总长31.5千米，河流总长度31.5千米，河网密度0.3千米/平方千米，年径流总量3亿立方米，年排涝量6.3亿立方米，年最大排涝量9.5亿立方米。

三元镇主要自然灾害有干旱、洪灾、滑坡等；干旱灾害年均发生1次，主要发生在6月—8月，

三元镇境内已探明矿有天然气、煤矿等；森林资源丰富，森林覆盖率达50%以上。

2011年，三元镇下辖滩山坝1个社区，梯子河、麻柳、庙坝、罗家场、大城寨、邓教坪、何家坝、青杠垭8个行政村；下设11个居民小组、48个村民小组。

截至2020年6月，三元镇下辖1个社区、8个行政村：滩山坝社区、梯子河村、麻柳村、庙坝村、罗家场村、大城寨村、邓教坪村、何家坝村、青杠垭村， 镇人民政府驻滩山坝社区四社。

2011年，三元镇总人口23005人，其中城镇常住人口1676人，城镇化率7.3%；另有流动人口5695人。总人口中，14岁以下6000人，占26.1%；15—64岁9605人，占41.7%；65岁以上7400人，占32.2%；以汉族为主，达22990人，占99.9%；有土家、回2个少数民族，共15人，占0.1%。2011年，三元镇人口出生率9.8‰，人口死亡率4.7‰，人口自然增长率5.1‰，人口密度为每平方千米300人。

2017年末，三元镇常住人口为11932人。

截至2018年末，三元镇户籍人口为21710人。

2011年，三元镇财政总收入889万元，比2010年增长5.7%，其中地方财政收入247.6万元，比2010年增长18.9%；人均财政收入386.5元，比2010年增长16.8%。2011年，三元镇农民人均纯收入4971元。

2018年，三元镇有工业企业7个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市5个。

红心蜜柚、畜牧、水产、竹木是三元镇四大骨干产业。2011年，三元镇有耕地面积1.9万亩，人均0.8亩；林地面积4.4万亩。2011年，三元镇农业总产值达到0.8亿元，比2010年增长14.7%，占生产总值的67%；农业增加值3895万元。三元镇粮食作物以水稻、小麦为主。2011年，三元镇生产粮食1.3万吨，人均560千克，其中水稻4255吨，小麦571吨。三元镇主要经济作物有红心柚。2011年，三元镇红心蜜柚种植面积2.3万亩；油料作物种植面积0.6万亩，产量961吨，其中花生463吨，芝麻33吨，油菜165吨；蔬菜种植面积0.5万亩，产量2853吨，主要品种有萝卜、青菜头，其中萝卜2200吨，青菜头653吨。三元镇畜牧业以饲养生猪、肉牛、羊、土鸡为主。2011年，三元镇生猪饲养量4.2万头，年末存栏2.4万头；羊饲养量0.7万只，年末存栏0.4万只；牛饲养量0.9万头，年末存栏0.5万头；家禽饲养量71万羽，上市家禽31万羽。2011年，三元镇生产肉类2074吨，其中猪肉1476吨，牛肉552吨，羊肉46吨腐蛋25吨；畜牧业总产值0.4亿元。2011年，三元镇水果种植面积0.3万亩，产量15.1万吨，主要品种有红心蜜柚。三元镇渔业以鱼塘养殖为主，可用于水产养殖海域面积0.5平方千米，鱼塘养殖面积20亩，产量50吨；水产品总产量55万吨；渔业总产值60万元。

三元镇工业以酿酒、榨菜、复合肥、建筑、建材、粮油加工为主。2011年，三元镇工业总产值达到1800万元，比2010年增长1.2%，工业增加值2477万元。2011年，三元镇有规模以上工业企业23家，职工1000人，实现工业增加值2477万元，比2010年增长21.1%，其中大中型工业企业有4家，实现工业增加值100万元，比2010年增长1.6%；销售收入达到100万元以上的19家，达到50万元以上的4家。

2011年末，三元镇有商业网点27个，职工1073人。2011年，三元镇社会消费品零售总额达8040万元，比2010年增长2%；城乡集市贸易成交额5080万元，比2010年增长26%。

2011年，三元镇金融产业实现增加值2000万元，比2010年增长占生产总值的16%，实现税收8万元。2011年末，三元镇存款余额为2.5亿元，比2010年增长8%；人均储蓄1.1万元；各项贷款余额500万元，比2010年增长12%。

2014年末，三元镇有幼儿园1所，在园幼儿297人，教师9人；小学4所，在校生1101人，专任教师71人，小学适龄儿童入学率100%；初中1所，在校生669人，教师54人 ；初中适龄人口入学率99.9%，小升初升学率100%，九年义务教育覆盖率达100%。2011年，三元镇教育经费达1102.4万元，国家财政性教育经费896.4万元，财政预算内教育经费711万元，预算内教育事业费711万元；预算内教育经费（包括城市教育费附加）占财政总支出的比例为4.5%，比2010年提高了0.5个百分点。

2011年末，三元镇有科技人才29人，其中专业技术人才13人，经营管理人才2人，技能人才3人，农村实用人才11人。

2011年末，三元镇有艺术表演团体2个，演职人员13人，电影放映单位1个，年放映2场次；有文化站1个，建筑面积700平方米；公共图书室10个，建筑面积300平方米，藏书2万册；有档案室1个，建筑面积40平方米；文化行业从业人员30人，占全社会从业人员的0.3%，其中事业单位从业人员2人。2011年末，三元镇有体育场地4处；100%的城市社区和12.5%的村安装了健身器材，经常参加体育活动的人员占常住人口的5%。2011年末，三元镇广播综合覆盖率93%，全年公共广播节目播出时间800小时。2011年末，三元镇有线电视用户数为3784户，其中数字电视用户896户，电视综合覆盖率96%，全年公共电视节目播出时间1918小时。

2011年末，三元镇有各级医疗卫生机构10个，病床34张，其中公立卫生机构床位34张，每千人拥有医疗床位1.5张，固定资产总值300万元；专业卫生人员50人，平均每千人拥有卫生技术人员2.2人，平均每千人拥有执业（助理）医师0.5人，平均每千人拥有注册护士0.1人。2011年，三元镇医疗机构（门诊部以上）完成诊疗2.1万人次，住院手术26台次，出院病人0.1万人次。

2011年，三元镇城镇最低生活保障户数为31户，人数45人，支出7万元，比2010年增长11%，月人均130元，比2010年增长17.3%；城市医疗救助6人次，民政部门资助参加合作医疗45人次，共支出1400元，比2010年增长20%；农村最低生活保障户数751户，人数1719人，支出120万元，比2010年增长1.6%，月人均58.2元，比2010年增长16.4%；农村五保集中供养22人，支出8万元，比2010年增长14.3%；农村五保分散供养55人，支出12.1万元，比2010年增长16.8%；农村医疗救助74人次，民政部门资助参加合作医疗2614人次，农村临时救济460人次，支出8.76万元，比2010年增长10.4%；国家抚恤、补助优抚对象110人，安置义务兵、士官等11人，抚恤事业费支出56.8万元，比2010年增长5%；五项社会保险（不含新型农村社会养老保险）基金收入合计12万元，比2010年增长1.5%，基金支出合计18万元，比2010年增长3.6%。

2011年末，三元镇参加城镇基本养老保险3000人，比2010年末增加500人，其中参保职工120人，参保离退休人员30人，分别比2010年末增加22人和5人；参加企业基本养老保险200人，比2010年末增加60人；参加城镇基本医疗保险85人，比2010年末增加3人，其中参加城镇职工基本医疗保险45人，比2010年末增加13人；参加城镇居民基本医疗保险40人，比2010年末增加6人；参加医疗保险的农民工3000人，比2010年末增加150人。

2011年末，三元镇有县乡（镇）级公路2条，总长30千米。 三元镇有丰（都）垫（江）公路、梯（子河）青（龙）公路横穿镇域。

2014年，三元镇整修村道20公里、新修便民路4公里。投资1400万元启动向家坝水电站至红星穿心店畅通工程，完成大城寨.罗家场、青杠垭等村畅通工程24.6公里。筹资9万元整修村道公路30公里。

三元镇的地名来源于历史上一位在滩三坝每坝喝一元钱的酒的故事。

三元镇的特产为三元红心柚，该产品在国内外享有一定的知名度。

2017年11月，三元镇获评第五届全国文明村镇。

2020年5月26日，三元镇入选2020年农业产业强镇建设名单。

2022年11月1日，三元镇（红心蜜柚）被农业农村部公示为第十二批全国“一村一品”示范镇。