《显微镜下的大明》是马伯庸创作的历史类纪实文学，首次出版于2019年1月。该书通过挖掘明代罕见的民间档案文书，讲述了六个聚焦于一府一县乃至一村之内的故事，记录了当时底层平民的真实政治生活。这些故事通过细节来考察某一个切片、某一个维度，从而展现出整个时代的意义。作者将这些细节比喻为显微镜下的细胞，通过检验一滴血、一个细胞的变化，来判断整个人体的健康程度。这本书的目的是让读者从细微处读懂真正的古代中国。

本书讲述的，是六个深藏于故纸堆中的明代基层政治事件。作者从明代的一系列罕见民间档案文书里，挖掘出这些尘封已久的故事。这些档案是中国历史中绝无仅有的奇迹，它们着眼于平民的政治生活，而且记录极为详尽。在这里，我们能看到朴实的百姓诉求、狡的民间智慧、肮脏的胥吏手段、微妙的官场均衡之术，从无数个真实的细节里，展现出一幅极其鲜活的政治生态图景。这六个事件聚焦于一府一县乃至一村之内，记录的是最底层平民的真实政治生活：当遭遇税收不公时，他们如何愤起抗争；当家族权益受到损害时，他们如何兴起诉讼；当政治利益与商业利益发生矛盾，他们如何与官府周旋博弈；当朝廷要求整顿户籍，他们又是如何从中造假牟利。具体包括《学霸必须死——徽州丝绢案始末》《笔与灰的抉择——婺源龙脉保卫战》《谁动了我的祖庙——杨干院律政风云》《天下透明——大明第一档案库的前世今生》《胥吏的盛宴——彭县小吏舞弊案》和《正统年间的四条冤魂》。

长久以来，历史在人们脑海中的印象，是烛照万里的规律总结，是高屋建瓴的宏大叙事。这虽然是正确的，但视角实在太高了，高到没什么人情味。即使有些讲述者有意放低视角，也只停留在庙堂之上、文武之间，关心的是一小部分精英，再往下记录很少。普通老百姓的喜怒哀乐，社会底层民众的心思想法，往往会被隶书忽略。即使提及，也只是诸如“民不聊生”“民怨鼎沸”之类的高度概括，很少会细致入微地描写。2014年作者和一位喜欢明史的朋友聊天时，她讲到万历年间徽州有一桩民间税案骚乱，引起了作者的兴趣。听完讲述，作者去搜寻了一番资料，发现这桩在《明实录》里只有一句冷冰冰的记录的案件，在民间却有着详实的记录（当时的一位参与者把涉案的一百多件官府文书、信札、布告、奏章、笔记等搜集到一起），并被编成了一本合集——《丝绢全书》。如果把《丝绢全书》里的细节加入《明实录》所载内容之中，那么整个事件就能够变得鲜活起来。作者考虑到普通读者对阅读原始史料太过困难，无法自行提炼出故事。遂把这桩丝绢案整理出来，用一种不那么“学术”的方式转述给大众，创作出了《学霸必须死——徽州丝绢案始末》，并发表在其个人微博，引起了广泛关注。因此，作者在写完徽州丝绢案，随后又相继创作了《笔与灰的抉择——婺源龙脉保卫战》《谁动了我的祖庙——杨干院律政风云》《天下透明——大明第一档案库的前世今生》等几篇纪实。

这本书娓娓道来，用笔绵密细致。读者读来也可以从一个又一个细节当中，编织起一个复杂的明朝。作者力图以冷静克制的零度叙事，替那些生于尘埃、死于无闻的蝼蚁之辈作传，转述他们湮没于宏大历史中的声音。想要读懂大明，想要读懂中国古代政治，不可只注目于朝堂，亦要听到最底层的呐喊。在一个个普通人的遭遇中，才蕴藏着最真实的规律。

马伯庸（笔名），原名马力，出生于1980年，满族，内蒙古自治区赤峰人，文学创作一级，中国作家协会第十届全国委员会委员。2004年毕业于新西兰怀卡多大学经管系，2005年开始发表作品，2018年加入中国作家协会。著有长篇小说《长安十二时辰》《两京十五日》《显微镜下的大明》《古董局中局》《长安的荔枝》《大医》等。曾获2010年人民文学散文奖、2011年朱自清散文奖、2020年茅盾新人奖等。

2019年12月30日，亚马逊中国发布2019年度Kindle阅读榜单，《显微镜下的大明》位列“2019亚马逊中国Kindle年度付费电子书新书榜”前三名。2020年1月，该书再次位列“2019亚马逊中国Kindle年度付费电子书新书榜”前三名。

2021年5月，网剧《显微镜下的大明》正式建组开拍。2023年2月9日，由马伯庸创作的《显微镜下的大明》六案中的“丝绢案”改编而成的网络剧《显微镜下的大明之丝绢案》播出，该书作者并在该剧中首次担任编剧一职。

2019年9月，该书中的《笔与灰的抉择——婺源龙脉保卫战》被编入《中华文学选刊》2019年第9期。2019年6月，由马伯庸创作的非虚构作品《显微镜下的大明》被主持人张腾岳录制为有声书。