总鳍亚纲（学名：Crossopterygii），又称总鳍鱼类，原为肉鳍鱼总纲的一个重要类群，大致涵盖了除肺鱼外的所有肉鳍鱼类，通常为一亚纲级阶元，并下分为空棘鱼和爪齿鱼。

总鳍鱼类出现于泥盆纪，但至今仅2种：非洲拉蒂迈鱼（Latimeria chalumnae）和印尼拉蒂迈鱼（Latimeria menadoensis）。最早的“解剖学意义上的现代型空棘鱼”化石出自大约3.9亿前的中泥盆世晚期地层中。

总鳍鱼类和肺鱼类的原始类型拥有同样特征。若去除肺鱼，总鳍鱼即成为一个现代分类学范式下不予承认的多系群，而若包括肺鱼，则总鳍鱼类的概念已经和肉鳍鱼总纲完全等同。因此，总鳍鱼类这一概念现已被废弃。

词源为希腊文“krossoi”（意为穗状）和 “pterygion”（意为鳍），指多数总鳍鱼类各鳍均呈穗状，有发达肉质部分和串列的鳍基骨。历史上，由于肺鱼类和其他大多数肉鳍鱼类具有明显的形态区别，因此总鳍鱼概念大致涵盖了除肺鱼类外的所有肉鳍鱼类，通常为一亚纲级阶元，并下分为空棘鱼目、扇鳍鱼目和爪齿鱼目。现已公认，总鳍鱼下各类群联系起来的特征，不过是整个肉鳍鱼类的祖征，而肺鱼类的原始类型也同样拥有这些特征。若去除肺鱼，则总鳍鱼即成为一个现代分类学范式下不予承认的多系群，而若包括肺鱼，则总鳍鱼类的概念已经和肉鳍鱼类完全等同。因此，总鳍鱼类这一概念现已被废弃。

总鳍鱼类包括空棘鱼类和爪齿鱼类。

空棘鱼类，出现于泥盆纪，三叠纪时一度相当繁盛，至今孑遗2种，分别为非洲拉蒂迈鱼（Latimeria chalumnae）和印尼拉蒂迈鱼（Latimeria menadoensis），被称为活化石。

已发现的最古老的空棘鱼类化石记录分别来自澳大利亚和云南省早泥盆世布拉格期（大约4.1亿年前）地层中。澳大利亚布拉格期地层中发现的空棘鱼Eoactinistia仅保存下颌齿骨的一小部分；中国发现的云南昭通早泥盆世空棘鱼标本于1927年发现的德国中泥盆世的艾菲尔孔骨鱼（Euporosteus eifeliensis）相似，因此被命名为云南孔骨鱼（Euporosteus 云南龙蜥）。

拉蒂迈鱼属于被科学家认为早已灭绝的鱼类，只有化石的代表（空棘鱼类）。第一条拉帝迈鱼是在1938年，从非洲东海岸的东伦敦岛附近捞到的。体长1.5米左右，呈长梭形，躯体粗壮。头大，口宽，牙齿锐利。颅骨具特殊的颅间关节，是唯一保存了肉鳍鱼总纲特有颅间关节的鱼类。在头下下颌间有1对很大的喉板。躯体覆盖大而薄的椭圆形圆鳞，鳞片露出部分具很多小嵴或疣突，因而体表粗糙，体后部和鳍基部鳞较小。侧线完全。背鳍有2个：第一背鳍鳍条强度骨化，具嵴，呈棘状；第二背鳍与胸鳍、腹鳍、臀鳍外形相似，呈柄状，鳍条着生在很厚的肉质鳍柄上。偶鳍内骨骼排列分节为非对称式。尾鳍外形近似矛状，3叶，由一个中心小叶将整个尾鳍平分为上下两部。脊索终生存在，其上、下方有小块硬骨。肠内具螺旋瓣。鳔很小，无呼吸功能，只调节鱼体在水中的比重。卵胎生。

相隔14年，1952年，在马达加斯加岛的西北的科摩罗群岛的安殊昂岛附近，又得到了第二条拉蒂迈鱼。它是在14.6米的深水里捕到的。这条鱼身长1.39米，形状和前次发现的拉蒂迈鱼差不多。

云南孔骨鱼的标本长度分别为11.4mm和8.7mm，估计鱼体全长约9~10cm。以眶前角和眶后角为界，云南孔骨鱼具有加长的眶前区和眶区，这是典型的“现代型空棘鱼”的特征。云南孔骨鱼的耳感觉管分支处缺失上联合管。重建结果还显示了位于耳感觉管之间的一对前、后半规管，与重尾鱼（Diplocercides）的半规管相似。云南孔骨鱼表现出来的特征表明它属于“解剖学意义上的现代型空棘鱼”，它的发现代表了空棘鱼类从泥盆纪早期一直到今天，这一类原始肉鳍鱼类的身体基本形态几乎没有发生太大改变。云南孔骨鱼的发现，不仅填补了我国过去从未发现泥盆纪空棘鱼类化石的记录空白，而且将最早的“解剖学意义上的现代型空棘鱼”化石记录从中泥盆世晚期向前推到早泥盆世，前推了约1700万年，进一步完善了空棘鱼类的演化历史。

爪齿鱼类主要生活在泥盆纪，进入石炭纪后全部灭绝。爪齿鱼类化石记录十分破碎，尚未发现过保存好的爪齿鱼类脑颅化石，已知的化石材料显示，爪齿鱼类具有强壮的肩部，颅骨各部分可以扩张，方便制服和吞咽大的动物。标志性的巨大尖牙呈两簇轮状并排在下颌前端，称为“齿旋”。

爪齿鱼类身上混合了肉鳍鱼总纲干群特征、现代肉鳍鱼类典型特征，及其自身演化出的独有特征。我国古生物学家从来自我国云南省的最古老的爪齿鱼类———于氏箐门齿鱼化石上发现，它吻部有着一系列骨质的分枝小管，这种构造过去只在肺鱼中发现过，而且它的内耳和脑腔构造竟和空棘鱼类有很多相似之处。这些新证据表明，爪齿鱼类和空棘鱼类有很密切的亲缘关系。可以说，空棘鱼类刚刚出现不久的时候，有一个支系就分了出去，向着高度适应掠食生活的方向发展，从而演化成了爪齿鱼类。

硬骨鱼（Osteichthyes），出现于3.95亿年前的志留纪晚期或泥盆纪早期，一般认为是从棘鱼纲发展而来。分为2支：一支是辐鳍鱼纲（Actinopterygii），化石发现于泥盆纪，现在仍然是全球水域中最繁盛的类群。另一支是肉鳍鱼总纲（Sarcopterygii），包括总鳍鱼和肺鱼，具肌鳍和内鼻孔，出现于3.9亿年前的泥盆纪早期，中生代末期接近绝灭。现存的仅有矛尾鱼。

鱼类开始出现是在约4亿年前的古生代中期。最早的鱼类，即是最早的有颌下门，叫棘鲨，以后分化发展为各种鱼类，其中，古代的总鳍鱼类是陆生脊椎动物的祖先。由总鳍鱼类演变为四足登陆的两栖纲，这是脊椎动物从水中到陆地的进化，是脊椎动物发展史中的一个重要阶段。两栖类的繁盛时代是在约3.5亿年前的古生代后期。

总鳍鱼类特征包括发达的肉鳍，由一颅间关节将膜颅和脑颅同时分为前后两半，脊椎椎体不发达，粗大的脊索为主要中轴支撑，等等。现已公认，这些曾认为是将总鳍鱼下各类群联系起来的特征，不过是整个肉鳍鱼总纲的祖征。

拉蒂迈鱼，体表呈淡蓝色，被以圆鳞。有些体重达80千克。为肉食性鱼类，肠内具螺旋瓣。吻部中央具囊状吻器，以3对开口通向吻部表面，受三叉神经浅眼支支配。拉蒂迈鱼为卵胎生，卵的直径可达9厘米，重330克。曾在一条65千克重的雌体泄殖腔中发现5条30厘米长的胚胎期幼鱼，大部分成体性状。

辐鳍鱼，现代鱼类中种类最多的一亚纲，占现代鱼类数的90%以上，分布极其广泛。这类鱼有多种生态类型。其主要特征为体被硬鳞、圆鳞。没有内鼻孔。

总鳍鱼，具有中轴骨骼，是1条纵行的脊索而不存在椎体，颏下有1块喉板，肠内有螺旋瓣等一系列原始特征。早期的总鳍鱼类栖居于淡水中，有鳃、鳔和内鼻孔，能在气候干燥和水域周期性缺氧期间用鳔呼吸空气。

总鳍鱼类，在泥盆纪至二叠纪时期（4.16-2.51亿年前）广泛分布于世界各地，经历了迅速下降，然后在三叠纪末期（约2亿年前）几乎灭绝。

1938年12月，在非洲东南海岸的东伦敦岛附近的深海中捕到第一条，被命名为非洲拉蒂迈鱼（Latimeria chalumnae），直至1952年才在非洲科摩罗群岛附近捕到第二条，在本地区陆续捕到百条之多。1997年，在印尼苏拉威西岛发现了第二种拉蒂迈鱼——印尼拉蒂迈鱼（Latimeria menadoensis）。

科学界一直以为包括空棘鱼类在内的总鳍鱼类早在白垩纪早期就已从地球上灭绝消失了。1938年12月，拉蒂迈小姐在渔民刚打捞起的鱼中发现了一条不同寻常的鱼。这条鱼被鉴定为总鳍鱼类中的腔棘鱼，原来被认为已经灭绝了1亿2千万年（白垩纪早期）的动物突然被发现仍然生存在地球上，为了纪念拉蒂迈小姐对科学、对人类知识宝库做出的这一重大贡献，于是将这条鱼及其所代表的物种命名为拉蒂迈鱼。

张弥曼在云南曲靖泥盆纪早期地层中发现了一件珍贵的鱼类颅骨化石，经过连续磨片和细致观察，她发现这个头骨属于原始肉鳍鱼类先驱杨氏鱼。按照当时的分类方法，先驱杨氏鱼被归入总鳍鱼类，而总鳍鱼类被认为应该有一对内鼻孔，这是鱼类“登陆”时学会呼吸的关键构造。张弥曼在仔细检查蜡模后，并未找到这一关键特征。这一发现引起了古生物学界的广泛关注，重新审视了内鼻孔的起源问题，甚至对总鳍鱼类作为四足动物祖先的地位产生了质疑。经过深入探讨，全球古生物学界逐渐认同了张弥曼的观点，认为肉鳍鱼类的起源中心地区应该是中国云南曲靖。这一发现改变了古生物学界对于四足动物起源的认知。

总鳍鱼类曾经下分的各类群中，爪齿鱼类和空棘鱼类之间可能具有密切的演化联系。爪齿鱼类，主要生活在泥盆纪，进入石炭纪后全部灭绝。爪齿鱼类化石记录爪齿鱼具有强壮的肩部，颅骨各部分可以扩张，方便制服和吞咽大的动物。标志性的巨大尖牙呈两簇轮状并排在下颌前端，称为“齿旋”，口闭合时收入口腔顶部刀鞘般深深的窝中。

在中国云南早泥盆世布拉格期地层中发现的4.1亿年前的箐门齿鱼（Qingmenodus yui）是已发现的最古老的爪齿鱼类，全长大约15厘米，但是保存了完整的脑腔、内耳、神经和血管通路等一整套尚未在爪齿鱼类中发现过的重要脑颅形态信息，为研究爪齿鱼类乃至整个肉鳍鱼总纲早期演化历史补上了重要的一段证据。

空棘鱼类，出现于泥盆纪，三叠纪时一度相当繁盛，至今孑遗2种，分别为非洲拉蒂迈鱼（Latimeria chalumnae）和印尼拉蒂迈鱼（Latimeria menadoensis），被称为活化石。拉蒂迈鱼（拉丁文名称：Latimeria），肉鳍鱼类腔棘鱼矛尾鱼科的唯一现生代表。拉蒂迈鱼，体长1.5米左右，呈长梭形，躯体粗壮。头大，口宽，牙齿锐利。颅骨具特殊的颅间关节，是唯一保存了肉鳍鱼类特有颅间关节的鱼类。在头下下颌间有1对很大的喉板。