孔雅琪曾在2022年11月在
浙江省第十七届运动会上代表宁波队获得女子14岁至16岁组100米自由泳和200米自由泳两项冠军。2023年3月，孔雅琪在全国青年游泳锦标赛上获得女子100米、200米自由泳亚军，均刷新个人最好成绩。2024年3月，孔雅琪在
全国春季游泳锦标赛上获得女子200米自由泳冠军、400米自由泳亚军和100米自由泳亚军三项荣誉，其中200米夺冠成绩达到奥运A标。
2024年6月18日，孔雅琪入选
中国国家游泳队参加
2024年巴黎奥运会的运动员名单。8月2日，在2024年巴黎奥运会女子4×200米自由泳接力决赛中，孔雅琪获得铜牌。
2022年11月，代表宁波游泳队参赛的孔雅琪在
浙江省第十七届运动会女子14岁至16岁组100米自由泳决赛中以56秒48获得金牌。随后，孔雅琪又获得200米自由泳冠军。
2023年3月，孔雅琪在全国青年游泳锦标赛上以56秒02获得女子100米自由泳亚军并刷新个人最好成绩；还以1分59秒70获得200米自由泳亚军，同样刷新个人最好成绩。5月5日，孔雅琪和
余依婷、
柳雅欣、吴卿风帮助浙江队在
2023年全国游泳冠军赛女子4×200米自由泳接力中以7分54秒97获得亚军。11月2日，孔雅琪在全国第一届学生（青年）运动会游泳比赛（公开组）女子100米自由泳决赛中获得第三名。同日晚，孔雅琪所在的宁波队在女子4×200米自由泳接力中获得金牌。
2024年3月4日，孔雅琪获得2024年全国春季游泳锦标赛女子200米自由泳冠军，400米和100米自由泳均获得亚军，其中200米自由泳1分57秒04的夺冠成绩达到奥运A标。4月21日，孔雅琪在
全国游泳冠军赛女子200米自由泳决赛中以1分57秒04获得第五名（与
葛楚彤并列），并达到奥运A标。4月24日，由孔雅琪、
劳丽慧、
秦帆、
汤慕涵组成的浙粤联队在
2024年全国游泳冠军赛女子4×200米自由泳接力决赛中以7分57秒22获得亚军。
2024年6月18日下午，国家体育总局游泳中心公示入选
2024年巴黎奥运会跳水、游泳、马拉松游泳、花样游泳项目运动员名单，孔雅琪榜上有名。8月2日，在
2024年巴黎奥运会女子4×200米自由泳接力决赛中，孔雅琪所在的中国队夺得铜牌。10月20日，2024游泳世界杯上海站女子800米自由泳决赛，孔雅琪8分27秒21获得铜牌。