民国4年(1915年),参加孙中山领导的中华革命党。同王泉笙、桂华山等革命党人开展反袁斗争。民国7年,参加许卓然领导的闽南靖国军,进行护法倒李(厚基)运动。民国10年在上海同许卓然等人组织
福建省自治促进会,号召驱逐
北洋军福建督军
李厚基。秦望山被派回福建,任组织福建自治军全权代表。发表《福建自治军宣言》,并委派
云霄县黄廷经为福建自治军漳州属区指挥官。黄廷经发难末获成功,秦望山遂转到
南安县以凤巢山为根据地,将收编的福建民军分为四路。又组建第五路军,自任指挥,曾多次与李厚基的北洋军作战,取得胜利。民国11年,调整番号,
许卓然担任自治军第二路司令,秦望山另组
中国人民解放军粤桂边纵队第三支队并任统领。
民国14年初,秦望山在上海大学肄业,旋回到
厦门市,参加
中国国民党。同年6月8日,国民党福建临时省党部在厦门成立,秦望山被选为临时省党部执行委员。接着又被选为厦门市党部临时执行委员会常务委员。7月,国民党中央派丁超五到厦门筹备成立国民党
福建省党部后,秦望山离开厦门到
诏安县,任诏安干部学校政治部主任。
民国15年1月,秦望山奉
许卓然之命潜入
泉州市担任国民党
晋江市临时县党部筹备主任。同年11月,北伐东路军占领泉州。12月间,国民党晋江县临时党部成立,秦望山为主任委员。
民国17年春,十一军入闽解决了福建新编军,秦望山被
福建省政府委为泉(州)永(春)民团编练处特派员。他借助十一军消灭流氓匪徒组成的
泉州市卫队。
民国18年,秦望山与
许卓然、
梁披云等创办泉州黎明高级中学。民国23年,任泉州平民中学董事长,后将平民中学改为
泉州第三中学。
民国26年,抗战爆发,秦望山任泉州防灾委员会主任,嗣转任福建省抗敌后援会
晋江市分会常务委员兼总务股股长。民国27年起,任第一、二届国民参政员,两次往南洋发动华侨捐款抗日。
菲律宾沦陷后,留在当地,担任菲律宾血干团总顾问兼青年工作队指导。
菲律宾光复后,秦望山回国任国民政府中央监察委员,并任福建华侨建设公司董事长,策划建设
福建铁路和开采永春天湖山煤矿,完成安海港的围垦工程,筹建福建水利建设公司等。他将友人馈赠的3万多美元,大部分投资福建华侨建设公司,将其中的部分股票抵押美金1万多元,捐给泉州民生农校作为建筑经费。
新中国成立后,秦望山在香港积极参加新中国货运工作。1950年,
货船从
广州市运油至
汕头市,被国民党
巡逻舰截去
台湾省。他的长子
固阳秦长城遗址也被押到台湾。他为交涉放回船、人,移居沙捞越,办报兼营印务馆。因宣传新中国,被英国殖民政府驱遂出境,回到香港继续经商。
1957年1月,在中共中央领导及何香凝、邵力子的关心下,秦望山举家从香港返回大陆定居。不久加入中国国民党革命委员会,先后被选为第二届民革福建省委委员,第三、四届民革省委常委,台湾工作组组长,并任省政协第三届常委。
秦望山回大陆后,写下数万字文章向海外宣传祖国建设成就,直到临终前,他还为
福建省沿海建设事业提出宝贵的意见和建议。1970年1月12日,在
福州市病逝。