通慧禅寺始建于唐初，距今已近1500年历史，是佛教禅宗文化的发祥地之一，建于唐初，历史上被称为“十方
禅林”，是
樟树市最早的寺院，寺内因绘有“万佛像”而得名“万佛殿”。
通慧禅寺内现有
文天祥题“功德堂”和
乾隆所书“
大雄宝殿”匾额，鼎盛时常住和尚上百人，在历朝历代佛教界都有着较大的影响。该寺自建成以来，先后于清乾隆二十年、
同治五年进行过两次大的整修。这次通慧禅寺异地重建总投资1.5亿元，分三期竣工，占地面积约200亩。
建成后万佛殿将成为全国唯一的一所唐式药师道场，是一座具有佛教文化与园林相结合的寺院，将成为充分展示佛教文化和中药文化的盛地。对弘扬宗教和医药文化，建设和谐社会，发展
樟树市旅游业起到重要作用。该寺全部建成后，将成为海内外药界人士瞻仰中药文化的盛地。
千年古刹——通慧寺始建于唐初（公元626-631），距今已近1400年历史，是佛教禅宗文化的发祥地之一，座落于江西樟树市，史上被称为“十方
禅林”，寺内
大雄宝殿因绘有“万佛像”而得名“万佛殿”。
江西省在
清代就形成了“
景德镇市、樟树、
吴城镇、河口”四大著名古镇，其中景德镇以其“瓷文化”名扬天下，而樟树则以“药文化”扬名于世，享有“药不过樟树不灵，药不到樟树不齐”的美誉。
樟树市位于
赣江中部，水陆交通十分发达，溯赣水南上，过
赣州市走
梅关接北江闽粤桂；顺赣江北下，汇鄱湖入
长江直指中原
吴越，受地理环境的影响，樟树历来是兵家必争之地，有“
四会市要冲，八省通”之称。早在
唐朝，樟树就以其处于
广东省官道及赣江航道的枢纽位置，使得商贾云集，贸易通达繁荣，成为工商雄镇。古镇樟树在五千年前就有人类居住，繁衍生息，创造了灿烂的古代文化，其中宗教文化为其中的一支，早在
东汉建安七年著名道家葛玄就在
樟树市阁皂山悟道修真，采药炼丹，悬壶济世，成为“太极仙翁”，阁皂山由此成为江南
道教名山。
樟树最早的寺院是通慧禅寺，现座落于江西省樟树市
店下镇药王山，古有“十方
禅林”之称。寺前一望平川，环境清幽与道教福地阁皂山相望，寺周山峦起伏，
青竹繁茂，夹道苍松，清泉流淌，如诗如画，隐隐看似卧佛之形，浑然天成。可谓僧宅福地，佛家园。
唐初年间，因“
李渊沙汰寺僧，僧徒放还桑梓”而离京，当时高僧，
道宣，经钟陵江至
江西省四大古镇之一的
樟树市，见民风纯朴，因缘殊胜，宣师心喜，遂开田建寺，名曰“通慧寺”。
会昌年间（公元841-843），观察使
李元爽，倾幕希运禅法，遂迎师至通慧寺，时常请益。希运禅师住世时，黄蘖门风，盛极江南，常以棒、喝之法启悟弟子。后来这一方法被门人临济义玄继承下来，发扬光大，创“临济宗”。鼎盛时期常住僧人上百人，在历朝历代佛教界有着较大的影响，
文天祥题“功德堂”和
乾隆所书“
大雄宝殿”匾额至今尤存。
通慧寺经历唐、
五代十国、宋、元、明、清等七个朝代，历史悠长，其间高僧辈出，宣祖之后，有黄蘖希运禅师、黄梅归云禅师；慧僧了明禅师；宋了常禅师、元法净禅师；明谌然、道如禅师、无相大智禅师；清法通禅师；民国了空、圆光禅师；
新中国成立时，海莲禅师“重开祖庭，提倡宗风”。
2004年，临济宗第48代法脉传人：上照下尘法师，观此感叹，发愿在中国药都，
樟树市，将通慧寺建设成“世界第一座药师万佛主殿”的药师道场。
释照尘法师，深圳弘法寺受具足戒，毕业于闽南佛学院，在
香港特别行政区、
广东省、东南亚各地参学深造，2003年至2004年任
余杭区慧日寺当家。他重修通慧寺的宏愿，在当地各级党和政府的正确领导和社会各界的关心下，在社会贤达、大德护法居士们的鼎力护持下，今已促成盛举。
如今的通慧寺，寺前一望平川，环境清幽与
道教福地皂山南北相望。因主殿供奉庄严、灵验的消灾延寿药师佛，修行药师法门，被善信称为继中国佛教四大名山之后：中国第五大应化道场，天下寿地。作为中国第一大药师道，今日通慧寺，再现其缭绕千年不断的香火，续佛慧命，展现在世人面前的是：香烟缭绕，言传王岳，声遍神州——只为普度群生。
通慧禅寺经历唐、
五代十国、宋、元、明、清等七个朝代，可谓历史悠长，其间高僧辈出，宣祖之后，有黄蘖希运禅师、黄梅归云禅师；慧僧了明禅师；宋有了常禅师、元有法净禅师；明有谌然、道如禅师、无相大智禅师；清有法通禅师；民国有了空、圆光禅师；
新中国成立时海莲禅师“重开祖庭，提倡宗风”。斗转星移，时光流逝，
通慧禅寺几经苍桑。 2007年5月26日，
通慧禅寺举行药师佛开光盛典；2008年10月13日，通慧禅寺药师
万佛殿奠基典礼；2010年3月21日，药师万佛殿上梁祈福法会，地方政府领导、诸山长老、社会贤达和善男信女数千人到会，共祝盛事。如今的通慧禅寺，成为世界第一座以药师万佛殿为主殿的药师道场，再现其缭绕千年不断的香火，续佛慧命，展现在世人面前的又是一番景象：香烟缭绕，晨钟暮鼓，言传王岳，声遍神州，成为第一大药师道。