南秦州刺史是中国历史上的官职名称，其职责范围主要涉及南秦地区的行政管理。

公元368年，杨世向当时的政权前秦表示归顺并效忠，随后被授予南秦州刺史一职。

到了公元371年四月，随着前秦势力的扩张，杨统接替了杨世成为新的南秦州刺史，并且同时被委以都督南秦州诸军事的任务，负责保卫位于仇池的据点。

公元373年十一月，前秦皇帝苻坚对地方官员进行了调整，其中王统被任命为南秦州刺史，他的职务地点设在仇池。

公元385年七月，前秦太子苻宏到达下辨地区，当时担任南秦州刺史的是杨璧，但他并未接受苻宏的到来。同年十一月，左将军窦冲在兹川一带聚集了一支规模达数万人的军队。此时，包括王统在内的多位地方官员，如天水市刺史王统、河州刺史毛兴、益州刺史王广以及卫将军杨定等，均从陇右地区派出使节，邀请苻丕前来领导他们对抗后秦。