5月下旬，黎元洪解除段祺瑞的总理职务。为此，5月21日，张勋在徐州市召集部分督军聚会，谈论推翻黎元洪。1918年秋，直、皖两系矛盾加剧，督军团组织分化，无形中趋于瓦解。

督军团，正式名称是“各省区联合会”，1916年夏至1918年间北洋政府系督军为干政和镇压民主革命力量而组织的团体。

督军团是一部分北洋地方军阀为争夺权力而暂时聚合的松散同盟，成员无定数，章程无约束力。

1916年6月，袁世凯病逝，洪宪帝制失败，北洋政府大一统局面告终。7月，黎元洪继任总统，段祺瑞任总理，把袁世凯在世时称为将军的各省军事长官改称督军。各省督军拥兵自重，踞地称雄。在北洋军阀势力范围内，督军觊觎中央政权的现象也日趋公开化。

会议早在洪宪帝制覆灭之初，憎恨共和、蓄谋拥清复辟的长江巡阅使张勋就曾召开徐州会议，决议组织吉林省、黑龙江省、辽宁省、直隶、山西省、安徽、河南省七省军事攻守同盟，巩固团结，保境安民，实施宪政，“抵制暴烈分子参预政权”（暗指中国国民党）。是为第一次督军团徐州会议。

同年9月22日，山东省、沈阳市、吉林、黑龙江、河南、直隶、浙江省、江苏省、湖北、江西省、绥远省、察哈尔省、热河十三省督军代表再次集会于徐州市，由张勋、倪嗣冲领衔宣布成立“各省区联合会”，制定八条纲领，拥张勋为“盟主”，通电抨击“暴乱份子”（指国民党议员）及政府阁员借故扰乱国家政务。25日，张勋、倪嗣冲等34人通电反对唐绍仪就任外交总长。26日，唐绍仪辞职，并痛斥军人干政。

“各省区联合会”后来即被人称为督军团。

1917年1月9日，张勋、靳云鹏、徐树铮等在徐州第三次聚会，提出取缔国会、拥护段祺瑞任总理、淘汰阁员等干政主张。

同年4月，段祺瑞内阁与黎元洪总统府及国会围绕对德宣战问题争议不决。4月25日，段祺瑞在京召开各省督军及其代表军事会议，企图利用北洋各省督军强迫国会通过对德宣战案。5月10日，国会对参战提案进行表决，段祺瑞纵容军人组织流氓和无业游民围攻国会、殴打议员，激起社会公愤。5月13日，督军团分别宴请劝说各省议员，大部分国会议员拒绝督军团的粗暴干涉。5月19日，督军团诋毁国会制定的宪法草案将导致“暴民专政”，并以此为借口，要求解散国会。

5月下旬，黎元洪解除段祺瑞的总理职务。为此，5月21日，张勋在徐州市召集部分督军聚会，谈论推翻黎元洪。26日，安徽省长倪嗣冲率先通电称不承认罢免段祺瑞，宣布安徽独立。之后陆续有七省宣布独立，脱离中央。黎元洪被迫请张勋入京调解。张勋带领三千军队进京，并在7月1日，在北京拥爱新觉罗·溥仪丁巳复辟。段祺瑞乘机誓师讨逆，打败张勋，7月中旬，重新掌握中央政权（见张勋复辟）。

段氏标榜“共和再造”，废约法、毁国会，对外投靠日本，对内笼络督军团支持他的武力统一政策，挑起内战，妄图消灭孙中山为首的护法势力。

1918年秋，直、皖两系矛盾加剧，督军团组织分化，无形中趋于瓦解。