1989年至1991年，尚小明在山西省石楼县一中任教；1991年至1997年7月完成硕士和博士的学业。1997年7月起，尚小明在北京大学从事博士后研究工作。从1999年起，在北京大学历史学系中国近现代史研究中心任教，直到2000年8月，尚小明升任北京大学历史学系副教授。2010年起，尚小明升任教授、博士生导师，曾多次赴
日本、
香港特别行政区等大学讲学访问。2018年，出版书籍《
宋案重审》，该书揭示“宋案”实际上是由收抚共进会、调查欢迎国会团、操弄宪法起草等多个情节次第演进与交错进行而酿成的复杂案件。
尚小明的研究领域涉及清史到中国现代史，从学术史、社会史到政治史、教育史等。主要有《学人游幕与清代学术》《
留日学生与清末新政》等著作，并承担国家清史工程及教育部的科研项目。1999年获教育部和国务院学位委员会“首届全国百篇优秀博士学位论文”奖以及
北京大学优秀博士学位论文
一等奖。2010年获首届北京大学“人文杰出青年学者”奖，2013年再获该奖。同年入选教育部“新世纪人文社会科学优秀人才支持计划”。
1968年，尚小明出生，
山西省石楼县人。1986年考入
山西大学历史学系本科就读，1989年提前一年完成学业，获
学士。1989年至1991年，他在山西省石楼县一中任教；1991年，进入
北京大学历史学系攻读中国近
现代史，1994年7月获北京大学历史学硕士学位；1997年7月获
北京大学历史学博士学位，先后师从
王晓秋、刘桂生教授。
1997年7月至1999年6月，尚小明在北京大学从事博士后研究工作。1999年起，在北京大学历史学系中国近现代史研究中心任教，直到2000年8月，尚小明升任北京大学历史学系副教授。2001年，尚小明撰写的论文《门户之争，还是汉宋兼采？——析
方东树\u003c汉学商兑\u003e之立意》，发表于《思想战线》第1期。2002年，出版著作《
留日学生与清末新政》，该书籍于次年再次出版。
2005年3月，尚小明出版书籍《
清代士人游幕表》，此书籍通过对各时段士人游幕状况的分析，得到关于有清一代士人游幕的综合性结论。2006年，发表《抗战前北大史学系的课程变革》《孟森北大授课讲义三种编撰考》等数篇论文。次年，在北京参加“近代中国与近代文化”学术会议。2009年，与
丁则勤合编《丁则良文集》，该书籍由
清华大学出版社出版。2010年起，尚小明升任教授、博士生导师，曾多次赴
日本、
香港特别行政区等大学讲学访问。
2011年，尚小明分别在武汉、北京参加“
辛亥革命与百年中国”纪念辛亥革命一百周年国际学术讨论会和“辛亥革命与世界”纪念辛亥革命一百周年国际学术讨论会。转年，他的论文《民国大学的亚洲史教育》发表于《北大史学》第17辑。2013年，入选教育部“新世纪人文社会科学优秀人才支持计划”。2014年，在威海参加“纪念
中日甲午战争120周年国际学术讨论会”。
2016年11月11日，尚小明以“刺宋案”为主题，为
聊城大学历史文化与旅游学院师生做了一场学术报告。次年5月11日，尚小明应
山西大学历史文化学院邀请，作了题为“民初‘刺宋案’略谈”的主题讲座。2018年，出版书籍《
宋案重审》，该书揭示“宋案”实际上是由收抚共进会、调查欢迎国会团、操弄宪法起草等多个情节次第演进与交错进行而酿成的复杂案件。2020年，整理了《清末立宪运动史料丛刊》（立宪团体卷）等资料，由
山西人民出版社出版。2021年，参加了在武汉举办的第九届晚清史国际学术研讨会。同年6月25，“改良与革命”——第九届晚清史研究国际学术研讨会在湖北武汉召开，尚小明作主题报告。
2022年11月27日，尚小明为
华北电力大学马克思主义学院，以线上形式作题为“
宋教仁被刺真相剖析”的学术报告，尚小明分四个部分对“宋案”进行了剖析。2023年8月19日至23日，尚小明李大钊研究会青年骨干学术研修班（第二期）上讲授《如何研究历史问题》。
2015年，尚小明和
袁伟时就民国初年的一些历史问题发生了分歧乃至论争。袁、尚二人所讨论的问题，是中国近代史上重要的问题。4月23日，尚小明在《
团结报》上发文《
中国国民党与
袁世凯的较量可以如此曲解吗——袁伟时\u003c迟到的文明\u003e阅后小记,，反驳袁伟时所论民国初期国民党在与袁世凯的较量中，“不懂得妥协，使稳定的局面一再被破坏”，并直言袁伟时“一些认识实在肤浅、迂腐，乃至荒谬”，对历史的解释常常“背离基本事实，甚至可以说糟蹋历史”。5月1日，
袁伟时通过团结网作出回应，题为《评北大尚小明教授的恶劣学风》。在这篇回应文章中，袁伟时对尚小明的反驳逐条回应，以
孙中山和国民党在民初所做的五件大事为例，继续说明他们不懂妥协。