1943年5月，经过近两年的谈判，中美特种技术合作所正式成立，由戴笠任主任，梅乐斯任副主任，中方参谋长李崇诗，美方参谋长贝乐利，下设军事、情报、心理、气象、行动、交通、经理、医务、总务等9个组和1个总办公室、1个总工程处。

1941年偷袭珍珠港后美国海军情报所为收集对日作战情报而与军统美国站站长肖勃联系并提出意向的。1942年春，美海军情报所正式派遣梅乐斯到重庆市与戴笠进行谈判、到1943年4月在重庆磁器口签订合同。其内容共10项，主要有：国民政府军事委员会调查统计局向美方提供日本陆海空军在华活动的一切情报，协助解决美方人员在华期间的食宿交通问题；美方无偿供给军统局必要武器、无线电器材、气象器材及交通医药器材；美方人员在华享受外交人员待遇，并帮助军统局训练特务部队。

1941年12月7日，日本海军偷袭珍珠港成功，使美国最终参战。美国与日本隔太平洋相望，打击日本必须主要依靠海军及空军，掌握足够的气象、地理及军情信息就成了重要的工作。而美国认为中国国民党统治下的中国在地理位置上占有优势，可以为美国提供这些信息。为了赢得战争，美国必须要同中国的军情机构合作，在中国成立一个军事情报机构。1942年5月，美国海军中校梅乐斯（Mary Miles）奉命来到中国在中国驻美武官萧信如的帮助下，梅乐斯与军统戴笠取得了联系，并就合作事宜进行了磋商。

1943年4月15日中美双方共同拟定了一份名为《中美特种技术合作协定》的条约。中美特种技术合作所的成立得到了时任美国总统富兰克林·罗斯福和国民政府主席蒋介石的批准，成立于1943年4月15日，结束于1946年1月。中美特种技术合作所直接隶属于中美两国最高军事统帅部，总部设在重庆市西北郊的歌乐山下杨家山。成立时，中华民国外交部长宋子文、美国海军部长诺克斯、杜诺万少将、萧信如上校和梅乐斯、戴笠先后签名。国民政府军事委员会调查统计局领导人戴笠、美国海军中校梅乐斯分任主任参谋长中方两人，为郑介民和李崇诗，美方为贝利美。主任秘书中方为潘其武，美方为史密斯。中美合作所主要有情报组、气象组、心理组、军事组和秘密行动组，人事组，作战组，电讯组，联络组，研究分析组，供应组，医务组，会计组，总务组，运输组等部门组成。

在建阳区设立东南办事处，下辖上海市、闽侯县、定海、漳州市4个情报站，并在安徽雄村、临泉，湖南南岳，河南临汝，绥远陕坝，贵州息烽，江西修水，福建漳州、建瓯，瑞安市，广东梅县等地，开办训练班，培训特工。

据统计：从1943-1945年8月，中美合作所各训练班共训练单位22个，训练作战部队近5万人，各种干部1300多人，毕业学员5万多人，除忠义救国军归建外，剩下的3万多人编成64个教导营，国民政府军事委员会调查统计局武装力量因此大大加强。