藩主毛利氏，十六世纪中叶藩族
毛利元就以安艺郡吉田城为据点，领有中国地方十国120万石，其孙
毛利辉元与
织田信长对抗。信长死后与
丰臣秀吉妥协，参加执政，为五大老之一。
关原合战时为西军总大将，战败后被德川减封，领有周防、长门两国36.9万石。由于这次大减封，长州藩重新丈量土地，甚至把年供外的杂税小物成，木、盐田等都算入村高，以增加石高，同时实现国产品专卖制，以补充财政之不足。自1682年（天和2年）以来，屡次发布《节俭令》，削减藩士的知行，增收年贡，但并未解决财政的亏空。第七代藩主重就实现所谓
宝历检地，坚决推行藩政改革，结果增收三万石，以此为基金设置抚育方，为以后开发新田和在地方商人协助下实现国产品专卖奠定了基础，然而藩债不断增加，造成农民穷困，因此近世中期以后各地不断发生百姓一。
1831年（
天宝2年）以
濑户内海沿岸为中心，终于爆发了反对专卖制度的大暴动，以此为契机，以
村田清风为首的改革派上台，计划紧缩财政开支，重建乡村的统治。紧接着，周布政之助等从当时围绕开港问题的中央政局和海防需要出发，采取富国强兵和
重商主义的政策，长州藩很快成为尊王攘夷派的据点，经过文久3年（1863年）八月十八日政变及
幕府两次征伐长州以后，与萨摩藩同为讨幕运动的推动力量。
1865年（庆应元年）藩厅迁至周防山口，直到
废藩置县。维新后，
长州出身的人也是政府的权利中坚，以后该藩出生的官僚，军人形成了长州阀，在政界起支配作用。
山县有朋：三代、九代总理大臣、甲午战争中为日本第一军司令。日本陆军之父。